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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G004654`

染色体: Chr07 坐标: 59408630-59410019 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G004654`
名称	SmilChr07G004654
描述	UPF0481 protein At3g47200-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	59408630 - 59410019 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994535`
GeneID	`130994535`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994535`
原始查询	`LOC130994535`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	UPF0481 protein At3g47200-like
产物	UPF0481 protein At3g47200-like
Arabidopsis	`AT2G36430` (AT2G36430) transmembrane protein, putative (DUF247) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818217] identity=34.5; qcov=0.903; evalue=1.11e-41; confidence=low
Rice	`Os01g0562600` - identity=34.5; qcov=0.882; evalue=1.26e-34; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03140 (DUF247)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994535

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057775562.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057775562.1`
3	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057775562.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057775562.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775562.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:59408644`	`C`	`CTG`	2bp_insertion	frameshift_variant	4	B61,C23,C31,C49
`Chr7:59408644`	`C`	`CTG`	2bp_insertion	CDS_variant	4	B61,C23,C31,C49
`Chr7:59408645`	`C`	`CG`	1bp_insertion	frameshift_variant	95	A10,A14,A19,A20,A22,A5,B103,B104,B106,B11,B112,B117,B118,B119,B12,B120,B123,B124,B125,B127,B132,B136,B138,B139,B14,B140,B15,B2,B21,B22,B24,B25,B28,B32,B34,B46,B48,B49,B5,B61,B64,B68,B76,B79,B8,B81,B83,B85,B87,B88,B89,B90,B92,B96,C13,C14,C15,C22,C23,C24,C28,C29,C3,C31,C34,C35,C39,C4,C40,C41,C43,C44,C45,C48,C5,C52,C54,C59,C62,C63,C64,C66,C67,C68,C7,C72,C77,C78,C79,C85,D11,D3,D4,D5,D7
`Chr7:59408658`	`A`	`ATT`	2bp_insertion	stop_gained,frameshift_variant	21	A2,A7,B1,B124,B20,B38,B4,B73,B9,B91,C1,C10,C2,C21,C26,C42,C64,C69,C87,D6,D9
`Chr7:59408663`	`CCT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	21	A2,A7,B1,B124,B20,B38,B4,B73,B9,B91,C1,C10,C2,C21,C26,C42,C64,C69,C87,D6,D9
`Chr7:59408666`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B14,C37
`Chr7:59408711`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B12
`Chr7:59408727`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B12
`Chr7:59408741`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4
`Chr7:59408750`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B14,C37
`Chr7:59408793`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,B91,D10
`Chr7:59408805`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C42,C53

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775562.1

279 aa

140

279

DUF247

PF03140 DUF247 23-253 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775562.1`	Pfam	`PF03140`	DUF247	Family	23	253	2.2e-62	212.4	Plant protein of unknown function

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919579.1
ATGCAGATTGCTATAAGTACAAATCAGAATCAGAAACTGAGCGTAGGGGCAGAATCAGAATGCACAATCTACAGAGTTCATAAACATTTACGGAACGTGAACCCCAATGCTTACGAGCCCGAGGTGATCGCTATTGGCCCTTATCACCGCAACACGGATCATCTAAAAATGATGGAAGATTACAAGCTACGTTACCTCCAGCAGCTCATCATAAGGAAACCTTCCAACAATGTGGAAAGCTACGCAGCATGTGTGGGCAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994535
ATGCAGATTGCTATAAGTACAAATCAGAATCAGAAACTGAGCGTAGGGGCAGAATCAGAATGCACAATCTACAGAGTTCATAAACATTTACGGAACGTGAACCCCAATGCTTACGAGCCCGAGGTGATCGCTATTGGCCCTTATCACCGCAACACGGATCATCTAAAAATGATGGAAGATTACAAGCTACGTTACCTCCAGCAGCTCATCATAAGGAAACCTTCCAACAATGTGGAAAGCTACGCAGCATGTGTGGGCAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775562.1
MQIAISTNQNQKLSVGAESECTIYRVHKHLRNVNPNAYEPEVIAIGPYHRNTDHLKMMEDYKLRYLQQLIIRKPSNNVESYAACVGRLEAEARKCYADEPTSLSPSEFIQMLVLDGCFIVELLRKYGMVFLREKNDPIFQMVWMIISLQRDLMLFENQLPFFVLCELFDLIEAPGQHSRLRDLLVQFFHGLYPGGGYRGEASVAPREVKHLLHFIHRSWLPRCTGTGGRKQQDKRLQFINSAARLKEANVSVEWCDLICV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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