当前解析结果
SmilChr01G003606| 统一新 Gene ID | SmilChr01G003606 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G003606 |
| 描述 | membrane-anchored ubiquitin-fold protein 6-like |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 54590250 - 54593067 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130994537 |
|---|---|
| GeneID | 130994537 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130994537 |
| 原始查询 | LOC130994537 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | membrane-anchored ubiquitin-fold protein 6-like |
| 产物 | membrane-anchored ubiquitin-fold protein 6-like |
| Arabidopsis | AT1G22050 (MUB6)membrane-anchored ubiquitin-fold protein 6 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838810] identity=66.1; qcov=0.975; evalue=1.49e-52; confidence=high |
| Rice | Os02g0750600 (MUB3)- identity=66.7; qcov=0.966; evalue=4.87e-52; confidence=high |
| GO | GO:0005515 (protein binding) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF13881 (Rad60-SLD_2) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130994537 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cell membrane | 细胞膜 | 0.80000 | XP_057775566.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.20000 | XP_057775566.1 |
| 3 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.20000 | XP_057775566.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057775566.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057775566.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:54591102 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B114,C38,C75 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057775566.1PF13881
Rad60-SLD_2 6-116 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057775566.1 |
Pfam | PF13881 |
Rad60-SLD_2 | Domain | 6 | 116 | 1.2e-42 | 145.2 | Ubiquitin-2 like Rad60 SUMO-like |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。