当前解析结果
SmilChr07G004699| 统一新 Gene ID | SmilChr07G004699 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G004699 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr07G004699 |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 59894825 - 59898214 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130994544 |
|---|---|
| GeneID | 130994544 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130994544 |
| 原始查询 | LOC130994544 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130994544 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057775570.1 |
| 2 | Nucleoplasm | 核质 | 0.80000 | XP_057775570.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.60000 | XP_057775570.1 |
| 4 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.60000 | XP_057775570.1 |
| 5 | Nuclear body | 核内小体 | 0.40000 | XP_057775570.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:59894884 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B131,B70,C64 |
Chr7:59894888 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 5 | B45,B99,C16,C49,C84 |
Chr7:59894888 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B45,B99,C16,C49,C84 |
Chr7:59894893 |
TG |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 1 | B111 |
Chr7:59894893 |
TG |
T |
1bp_deletion | CDS_variant | 1 | B111 |
Chr7:59894935 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A14,D3 |
Chr7:59894942 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 6 | B133,B41,B78,C3,C46,C61 |
Chr7:59895079 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B2,B78,C50,D3 |
Chr7:59895178 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B69,C57 |
Chr7:59895211 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B28,B46 |
Chr7:59895215 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 1 | C46 |
Chr7:59895215 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C46 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。