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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G004718`

染色体: Chr07 坐标: 60048523-60066191 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G004718`
名称	SmilChr07G004718
描述	hydroxyproline O-galactosyltransferase HPGT3-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	60048523 - 60066191 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994547`
GeneID	`130994547`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994547`
原始查询	`LOC130994547`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hydroxyproline O-galactosyltransferase HPGT3-like
产物	hydroxyproline O-galactosyltransferase HPGT3-like
Arabidopsis	`AT2G25300` (AT2G25300) Galactosyltransferase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817068] identity=75; qcov=0.987; evalue=5.94e-89; confidence=high
Rice	`Os06g0177300` - identity=67.3; qcov=0.987; evalue=7.36e-82; confidence=high
GO	GO:0000139 (Golgi membrane); GO:0006486 (GO:0006486); GO:0016758 (hexosyltransferase activity)
KEGG	-
Pfam	PF01762 (Galactosyl_T)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994547

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057775572.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057775572.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775572.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057775572.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057775572.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:60048864`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B63
`Chr7:60048900`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C62
`Chr7:60049033`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B19,B52,B79,C65
`Chr7:60049039`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	10	B115,B121,B38,B5,B70,C26,C70,C71,C8,D5
`Chr7:60049056`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B131,B18,C50,C51,C87
`Chr7:60065375`	`C`	`CG`	1bp_insertion	frameshift_variant	5	A7,B128,B89,C47,C66
`Chr7:60065375`	`C`	`CG`	1bp_insertion	CDS_variant	5	A7,B128,B89,C47,C66
`Chr7:60065504`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B51,B97,C32,C62
`Chr7:60065544`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A7,A8,C35,C49
`Chr7:60065659`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C78
`Chr7:60065681`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B38,B39
`Chr7:60065689`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C18,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775572.1

158 aa

158

Galactosyl_T

PF01762 Galactosyl_T 5-140 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775572.1`	Pfam	`PF01762`	Galactosyl_T	Family	5	140	4.6e-24	86.0	Galactosyltransferase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919589.1
ATGGATGATAATCATGAGGAGGCTGATGAGGAATTGCCCAAGAAAGCAAAATTTTTCTTTAGCGCAGCAGTGCAGATGTGGGATGCAGAGTTTTACATTAAAGTTGATGACAATGTTGATCTGCAACTTGATGATTTGATTCAACTTATACAAAGCCGCCATGGTCAGGATAGTGCTTATATTGGTTGCATGAAGTCTGGGGAAGTAGTAGCTGAAGAGGGAATGCAATGGTATGAGCCTGAATGGTGGAAATTTGGTGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994547
ATGGATGATAATCATGAGGAGGCTGATGAGGAATTGCCCAAGAAAGCAAAATTTTTCTTTAGCGCAGCAGTGCAGATGTGGGATGCAGAGTTTTACATTAAAGTTGATGACAATGTTGATCTGCAACTTGATGATTTGATTCAACTTATACAAAGCCGCCATGGTCAGGATAGTGCTTATATTGGTTGCATGAAGTCTGGGGAAGTAGTAGCTGAAGAGGGAATGCAATGGTATGAGCCTGAATGGTGGAAATTTGGTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775572.1
MDDNHEEADEELPKKAKFFFSAAVQMWDAEFYIKVDDNVDLQLDDLIQLIQSRHGQDSAYIGCMKSGEVVAEEGMQWYEPEWWKFGDQKSYFRHAAGSIFILSKNLAKYIHINSASLKVYAHEDVSVGSWMMGLRATYIDDSRMCCSYSSQDKICSLA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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