当前解析结果
SmilChr07G003645| 统一新 Gene ID | SmilChr07G003645 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G003645 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr07G003645 |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 43225329 - 43226439 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130994567 |
|---|---|
| GeneID | 130994567 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130994567 |
| 原始查询 | LOC130994567 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | ribosome maturation factor [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818112]; symbol=AT2G35470; hit=AT2G35470; species=arabidopsis; confidence=low |
| 产物 | ribosome maturation factor [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818112]; symbol=AT2G35470; hit=AT2G35470; species=arabidopsis; confidence=low |
| Arabidopsis | AT2G35470 (AT2G35470)ribosome maturation factor [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818112] identity=32.9; qcov=1.19; evalue=3.16e-14; confidence=low |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130994567 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Endoplasmic reticulum | 内质网 | 1.00000 | XP_057775592.1 |
| 2 | Endoplasmic reticulum membrane | 内质网膜 | 0.80000 | XP_057775592.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057775592.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057775592.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057775592.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:43225733 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B111,B7,C86,D11 |
Chr7:43226109 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B11,B114,B17,B73,C30 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。