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同源 qcov 为最佳单个 HSP 在查询序列上的坐标跨度／序列长度；置信度是规则分级，不是已验证的正交关系。

Gene Card 基因详情

支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及有 accession 序列支持的文献基因名查询；公开文献名称仅收录身份已有序列证据的记录。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。
示例

当前解析结果

SmilChr07G003872

染色体: Chr07 坐标: 48240900-48250181 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一基因 IDSmilChr07G003872
名称SmilChr07G003872
描述uncharacterized SmilChr07G003872
染色体 / SeqIDChr07 / NC_080393.1
坐标与链方向48240900 - 48250181 / +

ID 对照

NCBI Gene IDLOC130994580
GeneID130994580
locus_tag-
NCBI 名称LOC130994580
原始查询LOC130994580

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述hit=Os08g0315200; species=rice; confidence=medium
产物hit=Os08g0315200; species=rice; confidence=medium
拟南芥-
-
水稻Os08g0315200
-
identity=36.31; qcov=0.497; evalue=1.06e-28; confidence=medium
GOGO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG-
PfamPF00098 (zf-CCHC); PF03732 (PEG10_N-capsid); PF19259 (Ty3_capsid)
InterPro-
eggNOG-
NRGeneID:130994580

打开注释模块

亚细胞定位候选（最多五项）

预测得分表示模型支持程度，不能作为定位概率；所有候选均需实验验证。

方法与数据说明

当前结果已使用全部46,325条核基因组蛋白的完整原生特征重算。逐条核验39×39×7 PROFEAT、1280维ESM2、整条序列及五组模型的定位判定；当前模型、阈值文件和执行种子有记录。历史缓存及历史执行版本仍未确认。结果为计算候选，预测得分表示模型支持程度，不是校准概率，也不代表实验确认或已建立的预测准确率。模型含部分动物相关标签，应谨慎解读其在植物中的适用性。 四舍五入后概率与阈值相等的481条记录已按未舍入模型值再次复核，原始投票全部一致。

排序定位位置预测得分蛋白 ID
1 细胞质 0.80000 XP_057775607.1
2 细胞核 0.60000 XP_057775607.1
3 细胞质颗粒 0.20000 XP_057775607.1
4 细胞质核糖核蛋白颗粒 0.20000 XP_057775607.1
5 细胞质基质 0.20000 XP_057775607.1

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置 参考等位基因 变异等位基因 类型 影响 携带材料数 材料
Chr7:48245607 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 2 B73,D4
Chr7:48245622 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 C65
Chr7:48245748 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 C20
Chr7:48245754 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 C20
Chr7:48245763 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 C20
Chr7:48245774 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 B22
Chr7:48245790 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 B22

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775607.1
338 aa
N
1
169
338
Ty3_capsid
PEG10_N-capsid
zf-CCHC
C
PF19259 Ty3_capsid 62-224 aa PF03732 PEG10_N-capsid 63-141 aa PF00098 zf-CCHC 322-338 aa
XP_057775608.1
325 aa
N
1
162
325
Ty3_capsid
PEG10_N-capsid
zf-CCHC
C
PF19259 Ty3_capsid 48-211 aa PF03732 PEG10_N-capsid 50-128 aa PF00098 zf-CCHC 309-325 aa
XP_057775609.1
325 aa
N
1
162
325
Ty3_capsid
PEG10_N-capsid
zf-CCHC
C
PF19259 Ty3_capsid 48-211 aa PF03732 PEG10_N-capsid 50-128 aa PF00098 zf-CCHC 309-325 aa
XP_057775610.1
325 aa
N
1
162
325
Ty3_capsid
PEG10_N-capsid
zf-CCHC
C
PF19259 Ty3_capsid 48-211 aa PF03732 PEG10_N-capsid 50-128 aa PF00098 zf-CCHC 309-325 aa
XP_057775611.1
325 aa
N
1
162
325
Ty3_capsid
PEG10_N-capsid
zf-CCHC
C
PF19259 Ty3_capsid 48-211 aa PF03732 PEG10_N-capsid 50-128 aa PF00098 zf-CCHC 309-325 aa
蛋白 ID 来源 结构域编号 结构域名称 类型 起始 aa 终止 aa E-value 得分 说明
XP_057775607.1 Pfam PF19259 Ty3_capsid Domain 62 224 1.1e-08 35.5 Ty3 transposon capsid-like protein
XP_057775607.1 Pfam PF03732 PEG10_N-capsid Domain 63 141 1e-13 52.1 Retrotransposon-derived protein PEG10, N-terminal capsid-like domain
XP_057775607.1 Pfam PF00098 zf-CCHC Domain 322 338 9.1e-06 26.2 Zinc knuckle
XP_057775608.1 Pfam PF19259 Ty3_capsid Domain 48 211 1e-08 35.6 Ty3 transposon capsid-like protein
XP_057775608.1 Pfam PF03732 PEG10_N-capsid Domain 50 128 9.4e-14 52.2 Retrotransposon-derived protein PEG10, N-terminal capsid-like domain
XP_057775608.1 Pfam PF00098 zf-CCHC Domain 309 325 8.7e-06 26.3 Zinc knuckle
XP_057775609.1 Pfam PF19259 Ty3_capsid Domain 48 211 1e-08 35.6 Ty3 transposon capsid-like protein
XP_057775609.1 Pfam PF03732 PEG10_N-capsid Domain 50 128 9.4e-14 52.2 Retrotransposon-derived protein PEG10, N-terminal capsid-like domain
XP_057775609.1 Pfam PF00098 zf-CCHC Domain 309 325 8.7e-06 26.3 Zinc knuckle
XP_057775610.1 Pfam PF19259 Ty3_capsid Domain 48 211 1e-08 35.6 Ty3 transposon capsid-like protein
XP_057775610.1 Pfam PF03732 PEG10_N-capsid Domain 50 128 9.4e-14 52.2 Retrotransposon-derived protein PEG10, N-terminal capsid-like domain
XP_057775610.1 Pfam PF00098 zf-CCHC Domain 309 325 8.7e-06 26.3 Zinc knuckle
XP_057775611.1 Pfam PF19259 Ty3_capsid Domain 48 211 1e-08 35.6 Ty3 transposon capsid-like protein
XP_057775611.1 Pfam PF03732 PEG10_N-capsid Domain 50 128 9.4e-14 52.2 Retrotransposon-derived protein PEG10, N-terminal capsid-like domain
XP_057775611.1 Pfam PF00098 zf-CCHC Domain 309 325 8.7e-06 26.3 Zinc knuckle

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

6 records

下载 cDNA FASTA
XR_009091802.1
GCAGAGTTATTATTTTAGCGTTATATTTTTATAACGTATGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACGCGACGAGGATTATTGAGCAATCAATAATTATTATTTCCAAGTTATAACTGACTTAGCAAAGTCATGTTATTTATTAATCGAGAAACAGAAGCAGTTATATTTTATTAGTGCTACTAGAAGTCGAGAAATTATTCCGACTGCAACGCAAATTCAATCTACGGATTTAATCTAGATTCATATTACTGTATT...
XM_057919624.1
AATGCAATTTTTTTATAAATGAATCCAGTTTATGGTTCTGATTTTTTTTATCAGAGGCAGAGTTATTATTTTAGCGTTATATTTTTATAACGTATGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACGCGACGAGGATTATTGAGCAATCAATAATTATTATTTCCAAGTTATAACTGACTTAGCAAAGTCATGTTATTTATTAATCGAGAAACAGAAGCAGTTATATTTTATTAGTGCTACTAGAAGTCGAGAAATTATT...

CDS

5 records

下载 CDS FASTA
lcl|NC_080393.1_cds_XP_057775607.1_39112
ATGCTAGAGTGTACTAATTGGCACATCTTTGCTATCAGAATGCCGCCTAAGAGAGGACGCCCTGCGAAAAACAATAACAATCGCAGAAACCGTAACGCTGTACCCGAAGAACCACAAGATGCTCGAGGACATAACCCATCCCCTCCGCCTCCGACTAGGAGAGTCGAAGAACTCTTTTTAAGGCAAAATCCACCTACGTTTGACGGAACGAGTGAACCGGCTGAAGCTGAGATTTGGGTGCGTGCAATGGAACGCATTTT...
lcl|NC_080393.1_cds_XP_057775608.1_39113
ATGCCGCCTAAGAGAGGACGCCCTGCGAAAAACAATAACAATCGCAGAAACCGTAACGCTGTACCCGAAGAACCACAAGATGCTCGAGGACATAACCCATCCCCTCCGCCTCCGACTAGGAGAGTCGAAGAACTCTTTTTAAGGCAAAATCCACCTACGTTTGACGGAACGAGTGAACCGGCTGAAGCTGAGATTTGGGTGCGTGCAATGGAACGCATTTTCAACTTTCTACGTTGTACTGATGAGGAGCGCCTATCTTG...

Protein

5 records

下载 Protein FASTA
XP_057775607.1
MLECTNWHIFAIRMPPKRGRPAKNNNNRRNRNAVPEEPQDARGHNPSPPPPTRRVEELFLRQNPPTFDGTSEPAEAEIWVRAMERIFNFLRCTDEERLSCVSFQLTGSADFWWEARRKILTPEQWASYTWEDFKTGLYDKYIPKSYRKKKEAEFYELKQGNKSVVEYDKEFCNLSRFAPQQVDTDEKMAEKFCAGLRYEIKMALASHGGLSYTESLNRALDVEAAMPSDKSAPLLISTPNDPPVASHTLKGKRKWDNNED...
XP_057775608.1
MPPKRGRPAKNNNNRRNRNAVPEEPQDARGHNPSPPPPTRRVEELFLRQNPPTFDGTSEPAEAEIWVRAMERIFNFLRCTDEERLSCVSFQLTGSADFWWEARRKILTPEQWASYTWEDFKTGLYDKYIPKSYRKKKEAEFYELKQGNKSVVEYDKEFCNLSRFAPQQVDTDEKMAEKFCAGLRYEIKMALASHGGLSYTESLNRALDVEAAMPSDKSAPLLISTPNDPPVASHTLKGKRKWDNNEDNINQTSKKVWQEY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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