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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G003873`

染色体: Chr07 坐标: 48257437-48270077 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G003873`
名称	SmilChr07G003873
描述	probable lipid phosphate phosphatase beta
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	48257437 - 48270077 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994581`
GeneID	`130994581`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994581`
原始查询	`LOC130994581`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable lipid phosphate phosphatase beta
产物	probable lipid phosphate phosphatase beta
Arabidopsis	`AT4G22550` (LPPbeta) Phosphatidic acid phosphatase (PAP2) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828351] identity=39; qcov=0.967; evalue=4.51e-33; confidence=medium
Rice	`Os02g0661800` - identity=44.1; qcov=0.92; evalue=3.3e-42; confidence=medium
GO	GO:0042392 (sphingosine-1-phosphate phosphatase activity)
KEGG	-
Pfam	PF01569 (PAP2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994581

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057775612.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	1.00000	`XP_057775612.1`
3	Golgi apparatus	高尔基体	0.20000	`XP_057775612.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057775612.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775612.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:48269611`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B106,B129,B46,B93,C20
`Chr7:48269613`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C3,C42,C70,C84
`Chr7:48269621`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B25,C11,C69,D2,D8
`Chr7:48269741`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A13,B13,B134,B87,B88
`Chr7:48269776`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C23,C31,C85
`Chr7:48269891`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B106,B129,B46,B93,C20
`Chr7:48270022`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B106,B129,B46,B93,C20

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775612.1

212 aa

106

212

PAP2

PF01569 PAP2 72-203 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775612.1`	Pfam	`PF01569`	PAP2	Family	72	203	1.8e-19	70.5	PAP2 superfamily

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

6 records

下载 cDNA FASTA

XR_009091807.1
TTGAGATGTAGAAATGATTGAAACTTTGCAGGCATAGTGAGGAGTGATGGAATCCAAAGCATCCGCAGATTCATCTGTGCTCTGCCGGCTGATCAACCTTGACGCCGCCGTCTCCCTCCATCTCTACACCTTCTTCCACCCCATCCTCCCTTTCTCTCTCCTCAAATCCCTCGAGCTCTCCGGCGATGGCCGTCTCTTCTTCCCCATTACCCTCTCCATTCTCTTCATCAACACCGCCCCCACCCCCGCCACCCTTCTCC...

XR_009091803.1
ATTGAGTTGAGATGTAGAAATGATTGAAACTTTGCAGGCATAGTGAGGAGTGATGGAATCCAAAGCATCCGCAGATTCATCTGTGCTCTGCCGGCTGATCAACCTTGACGCCGCCGTCTCCCTCCATCTCTACACCTTCTTCCACCCCATCCTCCCTTTCTCTCTCCTCAAATCCCTCGAGCTCTCCGGCGATGGCCGTCTCTTCTTCCCCATTACCCTCTCCATTCTCTTCATCAACACCGCCCCCACCCCCGCCACCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994581
ATGGAATCCAAAGCATCCGCAGATTCATCTGTGCTCTGCCGGCTGATCAACCTTGACGCCGCCGTCTCCCTCCATCTCTACACCTTCTTCCACCCCATCCTCCCTTTCTCTCTCCTCAAATCCCTCGAGCTCTCCGGCGATGGCCGTCTCTTCTTCCCCATTACCCTCTCCATTCTCTTCATCAACACCGCCCCCACCCCCGCCACCCTTCTCCTACTAAACCTCCTAATCGGCTCCATTTTGGACCTTCTCCTAATTGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775612.1
MESKASADSSVLCRLINLDAAVSLHLYTFFHPILPFSLLKSLELSGDGRLFFPITLSILFINTAPTPATLLLLNLLIGSILDLLLIGLIKHLIQRPRPVYNKNMFLSFAVDHWSFPSGHSSRVSFIATFCSIYSVQIADLWIVKLSNLDAHTWILEYFALMVWLWAGITSISRVLLGRHFVLDVVAGALLGVLEGLLVFRVFNVENFSFWFR

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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