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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G003879`

染色体: Chr07 坐标: 48422529-48427938 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G003879`
名称	SmilChr07G003879
描述	protein NRT1/ PTR FAMILY 6.3-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	48422529 - 48427938 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994584`
GeneID	`130994584`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994584`
原始查询	`LOC130994584`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein NRT1/ PTR FAMILY 6.3-like
产物	protein NRT1/ PTR FAMILY 6.3-like
Arabidopsis	`AT1G12110` (NRT1.1) nitrate transporter 1.1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837763] identity=67.3; qcov=0.993; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os10g0554200` (NRT1.1B) - identity=68.3; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0006857 (oligopeptide transport); GO:0010167 (response to nitrate); GO:0015112 (nitrate transmembrane transporter activity); GO:0016020 (membrane); GO:0055085 (transmembrane transport)
KEGG	-
Pfam	PF00854 (PTR2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994584

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057775614.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057775614.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775614.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057775614.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057775614.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:48423005`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,B140
`Chr7:48423049`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B56,C12,D2
`Chr7:48423667`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A6,B76,C86
`Chr7:48423669`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A6
`Chr7:48423671`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr7:48423681`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C27
`Chr7:48423869`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B134,B65,C53
`Chr7:48423875`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A6,B54,D11
`Chr7:48423923`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B75,C32,C68
`Chr7:48423924`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A21,B101
`Chr7:48423953`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B128,B15,B65,B73
`Chr7:48423986`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C27

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775614.1

588 aa

294

588

PTR2

PF00854 PTR2 103-526 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775614.1`	Pfam	`PF00854`	PTR2	Family	103	526	1.7e-115	386.8	POT family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919631.1
ACACAAAACCACAGCTATAAAAGGAAACACCTCGACAACCTTCGAAATCCACCCCTCACCAAAGAGAAGAGCTTAATTAAGGAATCCTTTGCTCCACTCTTTGCTTAGACCATTTTACATATACATATATATATATTAACCAAAAGAAAATAATAATTGAACAGAAATGGCTTCGGTGCTTCCGCAAACAAATATCGACGCCGGCGAAACCCTCCCCGACGCCTGGGACTACAAGGGCCGCCCCTCCCTCAAATCTGCCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994584
ATGGCTTCGGTGCTTCCGCAAACAAATATCGACGCCGGCGAAACCCTCCCCGACGCCTGGGACTACAAGGGCCGCCCCTCCCTCAAATCTGCCTCCGGCGGCTGGACCAGCGCCGCCATGATTCTCGGGGTCGAGGCCTTCGAGAGGCTGACGACGCTCGGCATCGCGGTGAACCTCGTCACTTACTTGACCGGAACCATGCATCTCGGCAATGCCGCCGCCGCCAACAATGTTACCAACTTTCTCGGCACTTCTTTCAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775614.1
MASVLPQTNIDAGETLPDAWDYKGRPSLKSASGGWTSAAMILGVEAFERLTTLGIAVNLVTYLTGTMHLGNAAAANNVTNFLGTSFMLCLLGGFIADTFLGRYLTIGIFATVQATGVTLLTISTTIPSLRPPKCTPNSEACIPASGTQFTVLYLALYLTALGTGGLKSSVSGFGTDQFDESDGKERKQMIKFFNWFFFFINTGSLGAVTILVYIQDNVGREWGYGICACAIVFGLVVFLSGTRRYRFKKLAGSPLTQIAA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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