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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G003904`

染色体: Chr07 坐标: 49213482-49217826 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G003904`
名称	SmilChr07G003904
描述	uncharacterized SmilChr07G003904
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	49213482 - 49217826 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994606`
GeneID	`130994606`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994606`
原始查询	`LOC130994606`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	SNARE associated Golgi protein family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837802]; symbol=AT1G12450; hit=AT1G12450; species=arabidopsis; confidence=high
产物	SNARE associated Golgi protein family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837802]; symbol=AT1G12450; hit=AT1G12450; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G12450` (AT1G12450) SNARE associated Golgi protein family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837802] identity=52; qcov=1.04; evalue=7.69e-111; confidence=high
Rice	`Os07g0467600` (P0003B09.20) - identity=48.1; qcov=0.818; evalue=1.31e-83; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF09335 (VTT_dom)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994606

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	0.80000	`XP_057775644.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.60000	`XP_057775644.1`
3	Golgi apparatus	高尔基体	0.20000	`XP_057775644.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057775644.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775644.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:49213913`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B100,C58,C7
`Chr7:49213974`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C23
`Chr7:49215666`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B136,B46,C20
`Chr7:49215699`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B25,B29
`Chr7:49215888`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C13
`Chr7:49215927`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A2,B95
`Chr7:49215978`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,B35
`Chr7:49215979`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C81
`Chr7:49216722`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr7:49216767`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B100,C58,C7,D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775644.1

305 aa

152

305

VTT_dom

PF09335 VTT_dom 120-239 aa

XP_057775645.1

297 aa

148

297

VTT_dom

PF09335 VTT_dom 120-239 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775644.1`	Pfam	`PF09335`	VTT_dom	Domain	120	239	7.9e-16	59.4	VTT domain
`XP_057775645.1`	Pfam	`PF09335`	VTT_dom	Domain	120	239	7.5e-16	59.5	VTT domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919662.1
ATCTAAAGCAAGCAACAACATAAAATAAAGCTTGCTTTACACCTACTATATAATCTCCGATTTTTCCTCTCCTTCTCTTCCTCCACTACCGCAGAATACATTTATCTCTCTTTCTCAATTCATATTAACCGAAAAAATAATAATGTAAAAAGGTGCATAAACGGCTATATTTTGACTATTGTTGCGAAACCCTGAATGCCCCCCTCAATTGGTGGGGCCCCCAAAATTTTCATCTTCTTTCATTGTTGAATAATTGGGAC...

XM_057919661.1
TTTCCTCTCCTTCTCTTCCTCCACTACCGCAGAATACATTTATCTCTCTTTCTCAATTCATATTAACCGAAAAAATAATAATGTAAAAAGGTGCATAAACGGCTATATTTTGACTATTGTTGCGAAACCCTGAATGCCCCCCTCAATTGGTGGGGCCCCCAAAATTTTCATCTTCTTTCATTGTTGAATAATTGGGACAGTTTTAGGTTCAATCCAATTGATCAAAATCACAAGCGGTTTTTGATTCGGGTTTGTGATGA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130994606
ATGACTTACAATGCCGGCCATGGCGATCTTAGGCTGGAGGTAGATTACGTGAAATTGGAGGTTGGCGGGGGCGGTGGTGCCGATGGTGGGGCCCAGTGCCTGAAGGAGGAGGTGTCGCCTTCCTGCGGCGTTGGAGGCGCCGGAGGCGAATGGTGGTGGTTGTTGTGGTGGTGGGCGAAGCTGCTACTGGTGGCTTTGTTTATTGGGGTGTTGCTTGCGGTTTTCTTAAAATGGATCGGACCCTTCGTCATGGAGAAGGA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057775644.1
MTYNAGHGDLRLEVDYVKLEVGGGGGADGGAQCLKEEVSPSCGVGGAGGEWWWLLWWWAKLLLVALFIGVLLAVFLKWIGPFVMEKEIIPLINWERESFSTKQLVLLIFGSLTIFPSILLPSSPSMWLAGMTFGYGYGFLLVVGGVIFGVSLPYFIGSLFYHKIQVWLERYPKRASVIRLAGEGSLFNQFRAVALIRISPFPYIIYNYCAVATDVKFGPYLLGTLVGMVPEIFLTLYTGIIIQTLADATDDRQTMSGSQI...

XP_057775645.1
MTYNAGHGDLRLEVDYVKLEVGGGGGADGGAQCLKEEVSPSCGVGGAGGEWWWLLWWWAKLLLVALFIGVLLAVFLKWIGPFVMEKEIIPLINWERESFSTKQLVLLIFGSLTIFPSILLPSSPSMWLAGMTFGYGYGFLLVVGGVIFGVSLPYFIGSLFYHKIQVWLERYPKRASVIRLAGEGSLFNQFRAVALIRISPFPYIIYNYCAVATDVKFGPYLLGTLVGMVPEIFLTLYTGIIIQTLADATDDRQTMSGSQI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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