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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G003933`

染色体: Chr07 坐标: 49650525-49654890 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G003933`
名称	SmilChr07G003933
描述	PGR5-like protein 1A, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	49650525 - 49654890 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994630`
GeneID	`130994630`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994630`
原始查询	`LOC130994630`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	PGR5-like protein 1A, chloroplastic
产物	PGR5-like protein 1A%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT4G22890` (PGR5-LIKE A) PGR5-LIKE A [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828388] identity=73.9; qcov=0.902; evalue=2.55e-151; confidence=high
Rice	`Os08g0526300` (OJ1191_A10.128) - identity=76; qcov=0.83; evalue=6.97e-146; confidence=high
GO	GO:0009535 (chloroplast thylakoid membrane); GO:0009773 (photosynthetic electron transport in photosystem I); GO:0016730 (oxidoreductase activity, acting on iron-sulfur proteins as donors)
KEGG	-
Pfam	PF30904 (PGRL1_C); PF30905 (PGRL1_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994630

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057775671.1`
2	Chloroplast thylakoid	类囊体	1.00000	`XP_057775671.1`
3	Chloroplast thylakoid membrane	类囊体膜	0.80000	`XP_057775671.1`
4	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.60000	`XP_057775671.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057775671.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:49651635`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B15,B9,C79
`Chr7:49652210`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A19
`Chr7:49653273`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B90,B92
`Chr7:49653296`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B78,B94
`Chr7:49653296`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B78,B94
`Chr7:49654527`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B103
`Chr7:49654542`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B124,B126,B40,C33,C60

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775671.1

306 aa

153

306

PGRL1_N

PGRL1_C

PF30905 PGRL1_N 79-155 aa PF30904 PGRL1_C 183-304 aa

XP_057775672.1

306 aa

153

306

PGRL1_N

PGRL1_C

PF30905 PGRL1_N 79-155 aa PF30904 PGRL1_C 183-304 aa

XP_057775673.1

306 aa

153

306

PGRL1_N

PGRL1_C

PF30905 PGRL1_N 79-155 aa PF30904 PGRL1_C 183-304 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775671.1`	Pfam	`PF30905`	PGRL1_N	Domain	79	155	1.8e-34	118.6	PGRL1 N-terminal domain
`XP_057775671.1`	Pfam	`PF30904`	PGRL1_C	Domain	183	304	2.5e-54	183.3	PGRL1 C-terminal domain
`XP_057775672.1`	Pfam	`PF30905`	PGRL1_N	Domain	79	155	1.8e-34	118.6	PGRL1 N-terminal domain
`XP_057775672.1`	Pfam	`PF30904`	PGRL1_C	Domain	183	304	2.5e-54	183.3	PGRL1 C-terminal domain
`XP_057775673.1`	Pfam	`PF30905`	PGRL1_N	Domain	79	155	1.8e-34	118.6	PGRL1 N-terminal domain
`XP_057775673.1`	Pfam	`PF30904`	PGRL1_C	Domain	183	304	2.5e-54	183.3	PGRL1 C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919688.1
TAGGCAGAATATATAGCATGGGGAAATCACGAAGCCTGAAACCCTCCATATCTGAAATATCTTGACATGCCACCTTGCAATATCCGAGGAATCGGTAAGCAACCAACAACTTTTTGTCAACTTCTCCTTAAATTTCCCTCCACATGTTGCGTTATCCTTAAACTTCCCTCACTTCCACCATTACCGTTATATTTCCCGCCTCCCTACATTCCCAAATGAACCAAGCCGCAGCTAGCACACCACCCTCCTTCCGCCGCAGA...

XM_057919689.1
TGAAATATCTTGACATGCCACCTTGCAATATCCGAGGAATCGGTAAGCAACCAACAACTTTTTGTCAACTTCTCCTTAAATTTCCCTCCACATGTTGCGTTATCCTTAAACTTCCCTCACTTCCACCATTACCGTTATATTTCCCGCCTCCCTACATTCCCAAATGAACCAAGCCGCAGCTAGCACACCACCCTCCTTCCGCCGCAGATGGCCACCGGACTTGGTTTCCCCGCAGCCAAATCCCTATTTCTAACTGCTCA...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC130994630
ATGGCCACCGGACTTGGTTTCCCCGCAGCCAAATCCCTATTTCTAACTGCTCACTTCGCAAAGCCCTCTTTTATTCCTACTTCTTCCTCGGCATCCACTAGAAAGTTGTCGATTAGACGCAATTTGGTGCTCAAAGCCACCACTGATCCACCAGGTGAGGTCGAAAAGGATGAAGTTGTTGATAGCAACGTCTTACAGTATTGCAGCCTGGATAAGAAACAGAAGAAGACTGTAGGGGAGATGGAACAGGAATTTCTTCA...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057775671.1
MATGLGFPAAKSLFLTAHFAKPSFIPTSSSASTRKLSIRRNLVLKATTDPPGEVEKDEVVDSNVLQYCSLDKKQKKTVGEMEQEFLQALQAFYYEGKSIMSNEEFDNLKEELMWEGSSVVMLSADEQRFLEASMAYVSGKPLLSDKEFDELKQKLKEDGSEIVVEGPRCSLRTRKVYSDLSVDYLKMFLLNVPAAVVALGLFFFLDDITGFEITYLLELPEPLSFLFTWFAALPLIVWLSFTLTNAIVKDVLILVGVCPN...

XP_057775672.1
MATGLGFPAAKSLFLTAHFAKPSFIPTSSSASTRKLSIRRNLVLKATTDPPGEVEKDEVVDSNVLQYCSLDKKQKKTVGEMEQEFLQALQAFYYEGKSIMSNEEFDNLKEELMWEGSSVVMLSADEQRFLEASMAYVSGKPLLSDKEFDELKQKLKEDGSEIVVEGPRCSLRTRKVYSDLSVDYLKMFLLNVPAAVVALGLFFFLDDITGFEITYLLELPEPLSFLFTWFAALPLIVWLSFTLTNAIVKDVLILVGVCPN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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