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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及有 accession 序列支持的文献基因名查询；未闭环名称仅提供候选导航。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G003965`

染色体: Chr07 坐标: 50445095-50450811 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G003965`
名称	SmilChr07G003965
描述	protein HOTHEAD-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	50445095 - 50450811 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994658`
GeneID	`130994658`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994658`
原始查询	`LOC130994658`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein HOTHEAD-like
产物	protein HOTHEAD-like
Arabidopsis	`AT1G12570` (AT1G12570) Glucose-methanol-choline (GMC) oxidoreductase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837814] identity=64.56; qcov=0.995; evalue=0.0; confidence=high
Rice	`Os04g0573100` (HTH1) - identity=67.33; qcov=0.948; evalue=0.0; confidence=high
GO	GO:0016614 (oxidoreductase activity, acting on CH-OH group of donors); GO:0050660 (flavin adenine dinucleotide binding)
KEGG	-
Pfam	PF00732 (GMC_oxred_N); PF05199 (GMC_oxred_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994658

打开注释模块

非零投票定位候选（最多五项）

Rank	定位位置	中文	五折投票比例	Protein ID
1	Vacuole	液泡	0.60000	`XP_057775703.1`
2	Lysosome	溶酶体	0.40000	`XP_057775703.1`
3	Secreted	分泌到胞外	0.20000	`XP_057775703.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:50446017`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	A24
`Chr7:50446017`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	A24
`Chr7:50446030`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B26,B93,C82
`Chr7:50446065`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr7:50446300`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B85
`Chr7:50446330`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B85,D6
`Chr7:50446341`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A2,A21,B10,B20,B40
`Chr7:50446384`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B101,B24,B53,D5
`Chr7:50446396`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C26
`Chr7:50446396`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C26
`Chr7:50446476`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr7:50447359`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B13,B65,B87,D6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775703.1

574 aa

287

574

GMC_oxred_N

GMC_oxred_C

PF00732 GMC_oxred_N 46-319 aa PF05199 GMC_oxred_C 415-559 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775703.1`	Pfam	`PF00732`	GMC_oxred_N	Domain	46	319	5.9e-20	72.7	GMC oxidoreductase
`XP_057775703.1`	Pfam	`PF05199`	GMC_oxred_C	Domain	415	559	9.6e-30	104.7	GMC oxidoreductase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919720.1
GTCACTATTTATATGCCTCCAAAAAAATTGTACATATTTCTTGAATTTTGCTACTTTTAAGCTCTCATCTTCAATCCCAACCTTCTTTTCATTCTCCAAACTTTTAGCTAGCTAGCCCTCTCAATTCTTTGCTCTTCCCCTTATTCAACAATTCAAACCCTTATATATACACATTATATATATAATATCAAGTGAGCTATATAGCTTTATTTTATTCTCTGATCATTTTGGAGATTTAATTGTTTTTACGAGTTAAAGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994658
ATGGATTTTTGGCTGTGGAGATTGTTCTTTGTTGCCTTAGCTGAGATTCTTCTCTTTCATGGCTTCTGCTCATCCGAGCAAGCTCCAAATTACAGCTTCATGCAGCAAGCAAGCTCAGCTCCACCAGTCTCCTACTACGACTACATCATCATCGGCGGCGGCACCGCCGGCTGCCCCCTCGCCGCCACGCTCTCCCAAAACTCCACCGTGCTCCTCCTGGAGCGCGGCCCCTCGCCCTACGGCAACCCCAACATCACCGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775703.1
MDFWLWRLFFVALAEILLFHGFCSSEQAPNYSFMQQASSAPPVSYYDYIIIGGGTAGCPLAATLSQNSTVLLLERGPSPYGNPNITEISSFGRALSDLSPASPAQRFISEDGVINARARVLGGGSCINAGFYTRAAAGYVAAAGWDGRLVNESYEWVEKVVAFEPPMKQWQSAVRDGLLEAGVNPYNGFTYDHLNGTKVGGTIFDGEGRRHTAADLLQYANPKGLTVMLHASVHKILFSIKGKKRPLAHGVIFRDVSGKK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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