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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G003981`

染色体: Chr07 坐标: 50770273-50772688 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G003981`
名称	SmilChr07G003981
描述	F-box protein PP2-A12-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	50770273 - 50772688 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994671`
GeneID	`130994671`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994671`
原始查询	`LOC130994671`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	F-box protein PP2-A12-like
产物	F-box protein PP2-A12-like
Arabidopsis	`AT1G12710` (PP2-A12) phloem protein 2-A12 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837826] identity=64.8; qcov=0.938; evalue=5.49e-131; confidence=high
Rice	`Os03g0116700` (OsFbox127) - identity=59.7; qcov=1; evalue=5.62e-124; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF14299 (PP2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994671

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057775726.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057775726.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057775726.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775726.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057775726.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:50770788`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	14	A2,B135,B139,B26,B29,B4,B84,B97,C26,C5,C7,C71,C72,C77
`Chr7:50770802`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr7:50770836`	`G`	`GT`	1bp_insertion	stop_gained,frameshift_variant	18	A22,B106,B108,B126,B15,B26,B27,B28,B36,B46,B47,B71,B91,C13,C32,C60,C61,C68
`Chr7:50770958`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B7
`Chr7:50771026`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A21,B101,B117,B2
`Chr7:50771078`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C14
`Chr7:50771078`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C14
`Chr7:50771163`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B58
`Chr7:50771946`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A18,B104,B140
`Chr7:50772416`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr7:50772466`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C77

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775726.1

288 aa

144

288

PP2

PF14299 PP2 120-278 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775726.1`	Pfam	`PF14299`	PP2	Family	120	278	1.9e-40	139.0	Phloem protein 2

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919743.1
CAGAAACACACACACACAAGGACAGATATACACACACCGTACGCGTCCACCTCCTACCTATATATCCCATCCAACTGGCTTTCCCTCTCATCTTCATTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTATACCAGAATCCGTATTCAAAACCACTCTCATCTTCATTCTCGTCCTTCCAATTACAGAAAATTCAATTCATCTCGTTGAAATAATCGCATGGGCTCATCATTTTCGTCGCCGGCGGTGACCGGGAGCGCCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994671
ATGGGCTCATCATTTTCGTCGCCGGCGGTGACCGGGAGCGCCATAGCCCCGTCGCCGGAGCCAGGGCTGGGGGACTTGCCGGAGAGCTGCGTGGCGGAGGTGCTGGGACACCTCGAGCCGCTACAGATCTGCCAGCTCGCAATGTTGAACCGGGCTTTCCGGGGAGCGTCGTCGGCCGATTCCGTTTGGGAATCGAAGTTGCCGGTTAATTACGAAAATCTGATCGGTAGAGTGTTCAAGCAGGATGCCTCTTTCTGCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775726.1
MGSSFSSPAVTGSAIAPSPEPGLGDLPESCVAEVLGHLEPLQICQLAMLNRAFRGASSADSVWESKLPVNYENLIGRVFKQDASFCKGLCKRDIYARLCRANSFDGGSKKVWLDKRTGNICMSVSSNGLAITGIDDRRYWSRIPTEESRFSSFAYLQQIWWFEVDGEIEFPFPAGSYSIFFRLQLGRTHKRFGRRVCSSEHVHGWDKKPVRFQLSTSDGQQATKQCYLKEQGRWIHYHAGDFVVSSSCKSMKVKFSMTQI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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