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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G003983`

染色体: Chr07 坐标: 50818134-50821205 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G003983`
名称	SmilChr07G003983
描述	scarecrow-like protein 28
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	50818134 - 50821205 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994672`
GeneID	`130994672`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994672`
原始查询	`LOC130994672`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	scarecrow-like protein 28
产物	scarecrow-like protein 28
Arabidopsis	`AT1G63100` (AT1G63100) GRAS family transcription factor [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842613] identity=52.7; qcov=1.06; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os06g0127800` (DLT) - identity=53; qcov=0.638; evalue=3.64e-131; confidence=high
GO	GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0043565 (sequence-specific DNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF03514 (GRAS)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994672

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057775727.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057775727.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775727.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057775727.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057775727.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:50818407`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B27,B50,B57,B58,D10
`Chr7:50818661`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B13,B87
`Chr7:50818662`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr7:50818674`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B7
`Chr7:50818756`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C77
`Chr7:50818764`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C14,C20,C26,C31
`Chr7:50818777`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C49
`Chr7:50818896`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C14,C20,C31
`Chr7:50818914`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A20,B115
`Chr7:50818949`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C14,C20,C31
`Chr7:50818967`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C20
`Chr7:50818971`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,B140

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775727.1

636 aa

318

636

GRAS

PF03514 GRAS 253-623 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775727.1`	Pfam	`PF03514`	GRAS	Family	253	623	1.5e-124	416.4	GRAS domain family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919744.1
AGTATATAAAAGCTCGGTTGCATTTCGCTGAATGGCTTTTTGGGTAGTGGGGTTCTTGATAAACGACTGATTTCTGCGAGAGATGATGACCGTTTTGTTTGTTTTCATGCATGCTTGATTGAGTTCTTGAATTTGGGGGGTTTTCTTGGGGGGGAATTTAGAATAGCATGGACGGTTTGAAGGGGGGAAGTGTTGATGATCATTCGTTTTCTGTGTTTTTCAGCTGCGAAATTGATTGGAGATGCGTCTTCTTCTGCAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994672
ATGTTGGCTGGGTGTTCTTCTACATTGGTTTCACCAAGGCATAGATTGAGGAGTGAAGCATCTGCACAGTTTCAAGCTTGTCACATCCCTGCAATGAGCACACAGAGGTTGGATTTGCCTTGTAGCTTCGGGCGAAAGGAGGCGTCGCGGCCGCAGGCTGTTAGGCCGGTTGGGATTTCAGTTGAGAAGCCTATTGAACAATCAAAGGGTTCTTCTCTGAGGCAGAACATCAGGCTCCCTCCTGTTGCAGCAGAGAGCAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775727.1
MLAGCSSTLVSPRHRLRSEASAQFQACHIPAMSTQRLDLPCSFGRKEASRPQAVRPVGISVEKPIEQSKGSSLRQNIRLPPVAAESRRERGDEFWERSKKKRYAAADEGGNYMSRVKKRKTGNGNGNEDLGQQLRSSEDFWFHEGEERVCFDPPPPLPPLSSIPWFDSVVAEVTDLGKSKDVQRVDPHPHKEASASGSGSSSTSSGGHTLAPGVVERGNGSSSRNPSEVAGHNHNHNGSQREQEQEHEYVELINLVVACA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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