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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G003992`

染色体: Chr07 坐标: 50983195-50985631 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G003992`
名称	SmilChr07G003992
描述	protein IQ-DOMAIN 22-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	50983195 - 50985631 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994681`
GeneID	`130994681`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994681`
原始查询	`LOC130994681`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein IQ-DOMAIN 22-like
产物	protein IQ-DOMAIN 22-like
Arabidopsis	`AT4G23060` (IQD22) IQ-domain 22 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828405] identity=37.1; qcov=1.19; evalue=7.51e-48; confidence=medium
Rice	`Os04g0569900` - identity=31.9; qcov=1.17; evalue=6.22e-24; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00612 (IQ); PF13178 (DUF4005)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994681

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoskeleton	细胞骨架	1.00000	`XP_057775734.1`
2	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057775734.1`
3	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057775734.1`
4	Nucleus membrane	核膜	0.20000	`XP_057775734.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775734.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:50983388`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C41,C64,C66
`Chr7:50983419`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B7
`Chr7:50983427`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B27,B50,C20
`Chr7:50983526`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A14,A8,B3,B81
`Chr7:50983627`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B27,B50,B57,C20
`Chr7:50984499`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B101,B24,B53,D5
`Chr7:50984615`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B72
`Chr7:50984713`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B95
`Chr7:50984729`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	27	A4,B113,B114,B120,B127,B133,B48,B69,B82,B90,B92,C12,C14,C19,C21,C24,C27,C29,C31,C35,C54,C56,C57,C58,C7,C87,D9
`Chr7:50984763`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A20,B111
`Chr7:50984830`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A20,B111,B115,B136,C57
`Chr7:50985012`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A14,A8,B3,B81

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775734.1

435 aa

218

435

DUF4005

PF00612 IQ 110-130 aa PF00612 IQ 133-150 aa PF13178 DUF4005 315-382 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775734.1`	Pfam	`PF00612`	IQ	Motif	110	130	2.7e-06	27.4	IQ calmodulin-binding motif
`XP_057775734.1`	Pfam	`PF00612`	IQ	Motif	133	150	2.7e-06	27.4	IQ calmodulin-binding motif
`XP_057775734.1`	Pfam	`PF13178`	DUF4005	Family	315	382	2.4e-09	38.4	Protein of unknown function (DUF4005)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919751.1
TTTGCTAATCCCATGTTTATATTTCTTTTCTCGGTTTTGACCATTTCACCTCACTCCCCAACTCTCGCTCCACACTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTAGAAATGCTCCATGCTCCGCCCTGCAAATCACCTCTAACACGAAATGGGCAGAGCTTCCAAATGGTTTAGAGGCTTGCTGGGCTTCAAGAAGCCCGACCCGAGCGCCGACCCGACCCAGAATCCGCCCTCCAAGAAGAGATGGAGCTTTCCCAAGGCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994681
ATGGGCAGAGCTTCCAAATGGTTTAGAGGCTTGCTGGGCTTCAAGAAGCCCGACCCGAGCGCCGACCCGACCCAGAATCCGCCCTCCAAGAAGAGATGGAGCTTTCCCAAGGCCAAACACCGCCGCCGATCCCACCACGCCGTCGCTCCGGGCGGCTATCTCGACGACGACGAGACCAGCAGGCAGGCCATCGCCGTAGCCGCCGCCACCGCCGCCGTCGCCGAGGCCGCCGTCGCAGCGGCCCATGCTGCCGCGGCGGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775734.1
MGRASKWFRGLLGFKKPDPSADPTQNPPSKKRWSFPKAKHRRRSHHAVAPGGYLDDDETSRQAIAVAAATAAVAEAAVAAAHAAAAVAHLTSGGGAHGAQNGVGYGGREERAAVVIQSHFRAYLSRRALRALRALVKLQALVRGHILRKQNVDKLRQLQALVRAQARARAGRHPVEESTRSSRFNHTARAPQEHAMLARGTKQYHQHRVEMQRNMSRPNKNLVFDPDKSPSPSPLIHHWMERRKGERAQMDQGSFITRIV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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