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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G003999`

染色体: Chr07 坐标: 51055482-51059023 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G003999`
名称	SmilChr07G003999
描述	RHOMBOID-like protein 2
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	51055482 - 51059023 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994687`
GeneID	`130994687`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994687`
原始查询	`LOC130994687`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	RHOMBOID-like protein 2
产物	RHOMBOID-like protein 2
Arabidopsis	`AT1G63120` (RBL2) RHOMBOID-like 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842616] identity=67.7; qcov=0.994; evalue=1.05e-154; confidence=high
Rice	`Os03g0116400` (OsRhmbd7) - identity=64.9; qcov=0.994; evalue=2.84e-156; confidence=high
GO	GO:0004252 (serine-type endopeptidase activity); GO:0006508 (proteolysis); GO:0016020 (membrane)
KEGG	-
Pfam	PF01694 (Rhomboid)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994687

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	0.80000	`XP_057775738.1`
2	Vacuole membrane	液泡膜	0.80000	`XP_057775738.1`
3	Golgi apparatus	高尔基体	0.40000	`XP_057775738.1`
4	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	0.20000	`XP_057775738.1`
5	Trans-golgi network	Trans-golgi network	0.20000	`XP_057775738.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:51055776`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C57
`Chr7:51055801`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A15,B102,B14,C10
`Chr7:51056040`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B133,B16,B45,D9
`Chr7:51056064`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B7
`Chr7:51056068`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C72
`Chr7:51056085`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C57
`Chr7:51056090`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C18,C2
`Chr7:51056144`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C18,C2,C35
`Chr7:51056200`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B120,B62
`Chr7:51056474`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B78
`Chr7:51056486`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A15,B102,B14,C10
`Chr7:51056549`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B120,B62

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775738.1

324 aa

162

324

Rhomboid

PF01694 Rhomboid 111-248 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775738.1`	Pfam	`PF01694`	Rhomboid	Domain	111	248	1.6e-44	152.3	Rhomboid domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919755.1
TTAAAAAAAAATCCTAGATAAAGACAAATGATAAAGTACACATATACTATACGATACTACATAGTGACACCGCTTCTCCACCTCAACTGCAACTGCAACGTCTACGCGCTTTCAATCCTAAACCTCCTCCATAAATAAACCCACCTTCCCCAACTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCTCTCACAAACACACACGCGCATACATATTTACAGAGTATAACAAGCTCGTTTAGCACTGACACAATATAATTAGGCGTTTACAGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994687
ATGATGGGAAATGGAGATCCAGAGAGGGGAGCAGCCAGAAAGCACAGAAACCAGAGCTACTACGCAGGAGCATACGACGCGGATTATCACGACTCCCATTGGACTTCCTGGCTCGTTCCGATGATCGTTGTGGCCAACGTCGCCATGTTCGTGGTCATCATGTTCGTCAACAACTGCCCCAAGAATCACGACGGCCTCCGCGGAGACTGCGTCGCCAAGTTCCTCGGCCGCCTCTCATTTCAGCCCCTCCGCGAAAACCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775738.1
MMGNGDPERGAARKHRNQSYYAGAYDADYHDSHWTSWLVPMIVVANVAMFVVIMFVNNCPKNHDGLRGDCVAKFLGRLSFQPLRENPLFGPSSSALEKLGALEWDKIVHRNQAWRLFTCIWLHAGVIHLLANMLSLVFIGIRLEQQFGFVRVGVIYLLSGIGGSILSSLFIRNNISVGASGALFGLLGAMLSELFTNWTIYTNKAAALFTLIVIIAINLAVGILPHVDNFAHIGGFLSGFLLGFVLLARPQFGWLEGRNR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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