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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G004010`

染色体: Chr07 坐标: 51131513-51146163 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G004010`
名称	SmilChr07G004010
描述	CASP-like protein 4A4
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	51131513 - 51146163 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994697`
GeneID	`130994697`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994697`
原始查询	`LOC130994697`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	CASP-like protein 4A4
产物	CASP-like protein 4A4
Arabidopsis	`AT4G11655` (AT4G11655) Uncharacterized protein family (UPF0497) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:2745700] identity=46; qcov=0.897; evalue=1.57e-33; confidence=medium
Rice	`Os05g0344400` - identity=31.1; qcov=0.684; evalue=2.6e-08; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04535 (CASP_dom)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994697

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057775748.1`
2	Endoplasmic reticulum	内质网	0.40000	`XP_057775750.1`
3	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.20000	`XP_057775750.1`
4	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057775750.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057775748.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:51131645`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B85
`Chr7:51144138`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D2
`Chr7:51144145`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D2
`Chr7:51144157`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D2
`Chr7:51145210`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B124
`Chr7:51145261`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	6	B64,B90,B91,B92,B97,C63
`Chr7:51145263`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	6	B64,B90,B91,B92,B97,C63

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775748.1

187 aa

187

CASP_dom

PF04535 CASP_dom 40-174 aa

XP_057775749.1

186 aa

186

CASP_dom

PF04535 CASP_dom 40-173 aa

XP_057775751.1

155 aa

155

CASP_dom

PF04535 CASP_dom 48-142 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775748.1`	Pfam	`PF04535`	CASP_dom	Domain	40	174	5.4e-11	43.2	Casparian strip membrane protein domain
`XP_057775749.1`	Pfam	`PF04535`	CASP_dom	Domain	40	173	5.3e-13	49.7	Casparian strip membrane protein domain
`XP_057775751.1`	Pfam	`PF04535`	CASP_dom	Domain	48	142	1e-07	32.6	Casparian strip membrane protein domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919768.1
CACAGACATATAAAATACATGAGAACATTGAAATTGTGCACTAAACCTATGAAGCAAGCAATTGCGCTGAATCTATAAGTAATTTGCGACATTATCTGATTGTAGAGTTCAATGCAGTTATTTTATTAGTTCATATAGTTACTTTATAGGTTTGGTGCAGTTCTTATAATAAGAAGCTTTTTATTTGAATCCCTCTATATATATAGCTATAAATTGTAGCACCCTTTTCTTGATTTCTGAGGTTGATATGTTGATTATTG...

XM_057919767.1
CACAGACATATAAAATACATGAGAACATTGAAATTGTGCACTAAACCTATGAAGCAAGCAATTGCGCTGAATCTATAAGTAATTTGCGACATTATCTGATTGTAGAGTTCAATGCAGTTATTTTATTAGTTCATATAGTTACTTTATAGGTTTGGTGCAGTTCTTATAATAAGAAGCTTTTTATTTGAATCCCTCTATATATATAGCTATAAATTGTAGCACCCTTTTCTTGATTTCTGAGGTTGATATGTTGATTATTG...

CDS

4 records

下载 CDS FASTA

LOC130994697
ATGTCTGGTGTTACAGTCTCTCCAGTTGCTGCAGCCTACTCACCGGCACAGCCTCCGTTGCCGACGCCGTCTCCATTCTCATTCTCGGTGGCTTCGACCAGGTGGAGCTCCAGACCTCCGGTGCAGACCGCGAGCATCCTCCTCAGGTACTGCTTCAATGCAAACATTTTGACAGCGATATATTCTGCCTATCAGATCTTCAAAAATATATGTGATTATGCTCAAACATGCATTTTCATCTCAGACACGGCATCTGACTA...

Protein

4 records

下载 Protein FASTA

XP_057775748.1
MSGVTVSPVAAAYSPAQPPLPTPSPFSFSVASTRWSSRPPVQTASILLRFLSLIFSFGSAFALVALPSTNTKLKKHPELLYCFNANILTAIYSAYQIFKNICDYAQTCIFISDTASDYISFIFDQQVAGYVLISASSVAVPLIQQMEVGTSLRNASVVSVCFSFASFLVTALAAFLSGYKLCKRIMW

XP_057775749.1
MSGVTVSPVAAAYSPAQPPLPTPSPFSFSVASTRWSSRPPVQTASILLRFLSLIFSFGSAFALVALPSTNTKLKKHPELLYCFNANILTAIYSAYQIFKNICDYAQTCIFISDTASDYISFIFDQVAGYVLISASSVAVPLIQQMEVGTSLRNASVVSVCFSFASFLVTALAAFLSGYKLCKRIMW

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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