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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G004019`

染色体: Chr07 坐标: 51258508-51261790 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G004019`
名称	SmilChr07G004019
描述	probable glutathione peroxidase 8
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	51258508 - 51261790 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994703`
GeneID	`130994703`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994703`
原始查询	`LOC130994703`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable glutathione peroxidase 8
产物	probable glutathione peroxidase 8
Arabidopsis	`AT1G63460` (GPX8) glutathione peroxidase 8 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842652] identity=76.2; qcov=0.97; evalue=1.18e-92; confidence=high
Rice	`Os04g0556300` (OsGpx1) - identity=72.7; qcov=0.976; evalue=1.01e-87; confidence=high
GO	GO:0004602 (glutathione peroxidase activity); GO:0006979 (response to oxidative stress)
KEGG	smil00480 (Glutathione metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00255 (GSHPx); PF00578 (AhpC-TSA); PF08534 (Redoxin)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994703

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057775757.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057775758.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057775757.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057775758.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775758.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:51258639`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C25,C31,C57
`Chr7:51258680`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C2
`Chr7:51258710`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B110,B131
`Chr7:51258747`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr7:51258860`	`A`	`AAG`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B97
`Chr7:51258860`	`A`	`AAG`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B97
`Chr7:51258884`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr7:51259010`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	A21
`Chr7:51259010`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	A21

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775757.1

236 aa

118

236

Redoxin

AhpC-TSA

GSHPx

PF08534 Redoxin 5-66 aa PF00578 AhpC-TSA 5-68 aa PF00255 GSHPx 8-115 aa

XP_057775758.1

165 aa

165

Redoxin

AhpC-TSA

GSHPx

PF08534 Redoxin 5-66 aa PF00578 AhpC-TSA 5-68 aa PF00255 GSHPx 8-115 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775757.1`	Pfam	`PF08534`	Redoxin	Domain	5	66	1.3e-06	28.9	Redoxin
`XP_057775757.1`	Pfam	`PF00578`	AhpC-TSA	Domain	5	68	4.3e-08	33.8	AhpC/TSA family
`XP_057775757.1`	Pfam	`PF00255`	GSHPx	Family	8	115	1.4e-42	144.3	Glutathione peroxidase
`XP_057775758.1`	Pfam	`PF08534`	Redoxin	Domain	5	66	6.6e-07	29.9	Redoxin
`XP_057775758.1`	Pfam	`PF00578`	AhpC-TSA	Domain	5	68	2.1e-08	34.9	AhpC/TSA family
`XP_057775758.1`	Pfam	`PF00255`	GSHPx	Family	8	115	6.6e-43	145.4	Glutathione peroxidase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919774.1
GTCCGACAAAGATAGTACTAGTATTTCAAGTAACTATTCAACTAGCATAGTTGCTACTTCGAGCTCTGAATTTAGAGTTCGGAAAAGTTCATCAAATTAATATTTAGGGTTATTCAGGAATTTGAATGGCGTCGGCTCAGTCTGCATTTGATTTCACCGTCAAGGATGCTAAAGGAAATCAAGTGGATTTAGGAATTTACAGAGGCAAAGTGTTGCTGATTGTGAATGTTGCCTCCAAATGTGGGATGACCAACTCGAAC...

XM_057919775.1
AAGATAGTACTAGTATTTCAAGTAACTATTCAACTAGCATAGTTGCTACTTCGAGCTCTGAATTTAGAGTTCGGAAAAGTTCATCAAATTAATATTTAGGGTTATTCAGGAATTTGAATGGCGTCGGCTCAGTCTGCATTTGATTTCACCGTCAAGGATGCTAAAGGAAATCAAGTGGATTTAGGAATTTACAGAGGCAAAGTGTTGCTGATTGTGAATGTTGCCTCCAAATGTGGGATGACCAACTCGAACTACATTGA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130994703
ATGGCGTCGGCTCAGTCTGCATTTGATTTCACCGTCAAGGATGCTAAAGGAAATCAAGTGGATTTAGGAATTTACAGAGGCAAAGTGTTGCTGATTGTGAATGTTGCCTCCAAATGTGGGATGACCAACTCGAACTACATTGAGCTAAATCAGTTGTATGAGAAGTACAAAGATCAAGGCCTGGAGATTCTGGCTTTCCCATGCAATCAATTTGGCGAAGAAGAACCTGGAAGCAATGATGAAATTATGGATTTTGTCTG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057775757.1
MASAQSAFDFTVKDAKGNQVDLGIYRGKVLLIVNVASKCGMTNSNYIELNQLYEKYKDQGLEILAFPCNQFGEEEPGSNDEIMDFVCTRFKSDFPIFDKIEVNGNDAAPLYKFLKLGKWGIFGDDIQWNFAKFLVDKTGHPVDRYYPTTSPLTVEVLDHLKTNMFCVYLPFLYGIINVINMIQRHCNHFLDRREILKISWGFHESTDEKSMLSEGTIIEPLMVISSINVSVPFCGN

XP_057775758.1
MASAQSAFDFTVKDAKGNQVDLGIYRGKVLLIVNVASKCGMTNSNYIELNQLYEKYKDQGLEILAFPCNQFGEEEPGSNDEIMDFVCTRFKSDFPIFDKIEVNGNDAAPLYKFLKLGKWGIFGDDIQWNFAKFLVDKTGHPVDRYYPTTSPLTVERDIKNLLGLP

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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