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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G004033`

染色体: Chr07 坐标: 51511186-51512423 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G004033`
名称	SmilChr07G004033
描述	uncharacterized SmilChr07G004033
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	51511186 - 51512423 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994717`
GeneID	`130994717`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994717`
原始查询	`LOC130994717`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF29561 (DUF8566)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994717

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057775769.1`
2	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057775769.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775769.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057775769.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057775769.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:51511550`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	46	A15,A4,A6,A7,B100,B102,B103,B11,B113,B114,B121,B124,B17,B31,B41,B43,B54,B56,B58,B69,B7,B73,B84,B90,B92,B96,C17,C21,C29,C3,C30,C35,C41,C42,C49,C53,C54,C56,C57,C61,C64,C66,C79,C84,D1,D9
`Chr7:51511639`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B137,B42,B43,C82
`Chr7:51511667`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	7	B39,B65,C13,C19,C22,D3,D5
`Chr7:51511842`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	6	A23,B103,B44,B72,C28,C77
`Chr7:51511852`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C77
`Chr7:51511861`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B42,B43
`Chr7:51511878`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B61,B64,C63
`Chr7:51511886`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B17
`Chr7:51511900`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B119,B81,C86
`Chr7:51511902`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A15,B102,C17,C42,C49
`Chr7:51511906`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B137,B42,C82
`Chr7:51511939`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A23,B139,B72

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775769.1

156 aa

156

DUF8566

PF29561 DUF8566 1-156 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775769.1`	Pfam	`PF29561`	DUF8566	Domain	1	156	4.7e-33	115.4	Domain of unknown function (DUF8566)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919786.1
AGTGTCAAGATTAAAGCTGAGGGTCCTAGCGTAAAGGTTGAAGACCGTAAACGGAAGACATATCGATCTACTGGGAAGAAGATTGTTTCGCATGGTGTCGATCCTGAAAGTGAGAATGTACGAGCCAATGGTGAAGAAAAATATGGACCTGATGACTTTATTTCAATTCACACAAGGTCTACAACATTAACTTTTCATGATTCAATTCGACGATTGAATCAAGCTCAATGCGCAGCTGTACGTGATATGGGGTTTGGTCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994717
ATGGGGTTTGGTCACTTGCTTCAGCTTCGAGTGAAGGGCATACCTTCAAAGCTTGCATATTGGGTGATTGATCACTTTGATAGTGATAAATCAGATTTCGAGTTGATGTTAGAGCACAAGGTTAAGGTTACTGAAGAAGACATTTTCAGAATTTACGGTTTCCTGAGAGTACTTGAAAAAATTGAAACGTTACGGAGTTCAGCAAATAGTAAGTTGATGGACGAGTGGATTGCTTCATTCAATGTTGACGATAAAGAAAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775769.1
MGFGHLLQLRVKGIPSKLAYWVIDHFDSDKSDFELMLEHKVKVTEEDIFRIYGFLRVLEKIETLRSSANSKLMDEWIASFNVDDKEKIKIKLVIAKMLNEIDGGIWFRRNFRLVMSFCLIESGSNGMVPPYILQVLDDVTMVSRLNWCEYTLRALI

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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