当前解析结果
SmilChr07G004049| 统一新 Gene ID | SmilChr07G004049 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G004049 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr07G004049 |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 51796513 - 51798344 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130994730 |
|---|---|
| GeneID | 130994730 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130994730 |
| 原始查询 | LOC130994730 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130994730 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057775779.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.40000 | XP_057775779.1 |
| 3 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.40000 | XP_057775779.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057775779.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057775779.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:51797252 |
GC |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 8 | A21,A3,B115,B119,B21,C49,C73,C86 |
Chr7:51797257 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 3 | A20,C54,C60 |
Chr7:51797257 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A20,C54,C60 |
Chr7:51797263 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 21 | A1,A13,A21,B117,B132,B21,B3,B41,B45,B52,B68,B75,B78,B85,C24,C26,C34,C51,C52,C75,D6 |
Chr7:51797265 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B109,B72,C73 |
Chr7:51797269 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A20,C54,C60 |
Chr7:51797284 |
TC |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 34 | A7,B100,B103,B114,B118,B121,B17,B2,B24,B26,B42,B46,B53,B56,B58,B73,B8,B84,B91,B92,B96,C1,C16,C3,C30,C33,C37,C4,C42,C53,C61,C64,C71,C84 |
Chr7:51797288 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B16,B45,C12 |
Chr7:51797291 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B126,C39 |
Chr7:51797292 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B26 |
Chr7:51797299 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A18,B140 |
Chr7:51797311 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B132,B60,C18,C62,D1 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。