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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G004112`

染色体: Chr07 坐标: 52780485-52783093 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G004112`
名称	SmilChr07G004112
描述	40S ribosomal protein SA-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	52780485 - 52783093 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994776`
GeneID	`130994776`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994776`
原始查询	`LOC130994776`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	40S ribosomal protein SA-like
产物	40S ribosomal protein SA-like
Arabidopsis	`AT1G72370` (P40) 40s ribosomal protein SA [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843569] identity=79.8; qcov=0.799; evalue=3.11e-146; confidence=high
Rice	`Os03g0182600` - identity=68.7; qcov=0.997; evalue=6.88e-139; confidence=high
GO	GO:0000028 (ribosomal small subunit assembly); GO:0002181 (cytoplasmic translation); GO:0003735 (structural constituent of ribosome); GO:0005840 (ribosome); GO:0022627 (cytosolic small ribosomal subunit); GO:0030686 (90S preribosome)
KEGG	smil03010 (Ribosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00318 (Ribosomal_S2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994776

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057775823.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057775823.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057775823.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775823.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057775823.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:52780718`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A21,B20,B74,B91,C72
`Chr7:52781139`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C32,C68
`Chr7:52781168`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C71
`Chr7:52781640`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr7:52781840`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48
`Chr7:52781879`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	6	B107,B109,B3,B37,B7,C43
`Chr7:52781925`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr7:52781931`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B4,B42,C54
`Chr7:52782012`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B5,C36,C44
`Chr7:52782926`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B82

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775823.1

304 aa

152

304

Ribosomal_S2

PF00318 Ribosomal_S2 20-114 aa PF00318 Ribosomal_S2 119-184 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775823.1`	Pfam	`PF00318`	Ribosomal_S2	Family	20	114	3.9e-23	82.5	Ribosomal protein S2
`XP_057775823.1`	Pfam	`PF00318`	Ribosomal_S2	Family	119	184	3.9e-23	82.5	Ribosomal protein S2

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919840.1
GTATTTAGAGGCCCATGGGTATTTAAATAAGTCTGCTAAAGTAAAAAAAAAAAAAACTAAGGGCTCTAAGTAAGAAATAGCTCTTCGTCTAGGGTTTGTTGCAGACTTGCAGTCGGAAAAGACAAGCCTTTGAGGAAGCAGCCATGGCGAGCGGCGGTGGGCAAAGGGTGCTGTCGACGAAGGAGGCCGACATCCAGATGATGTTGGCATCTGAAGTTCACCTAGGCACTAAAAACTGCGATTTTCAGATGGAGCGCTAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994776
ATGGCGAGCGGCGGTGGGCAAAGGGTGCTGTCGACGAAGGAGGCCGACATCCAGATGATGTTGGCATCTGAAGTTCACCTAGGCACTAAAAACTGCGATTTTCAGATGGAGCGCTACGCTTTCAAGCGCCGCAACGATGGAATTTTTATAATCAATGTTGGGAAAACGTGGGAAAAGCTTCAAATGGCTGCAAGGGTTATCGTAGCTATCGAGAATCCCCAGGACATCATTGTCCAGTCGGCCAGACCATATGGTCAGAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775823.1
MASGGGQRVLSTKEADIQMMLASEVHLGTKNCDFQMERYAFKRRNDGIFIINVGKTWEKLQMAARVIVAIENPQDIIVQSARPYGQRAVLKFAQYTGTQAIAGRHTPGTFTNQLQTSFSEPRLLILTDPRTDHQPIKEGALSSIPIIAFCDTDSPMRYVDIGIPANNKGKHSIGCLFWLLARMVLQMRGVIAPGHKWEVMVDLFFYRDPEEAKAEEPEEVLALPDYGDYNAAAGGDWSSAQIPDSQWAPDAAGAIPPVAS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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