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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G004118`

染色体: Chr07 坐标: 52860199-52862848 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G004118`
名称	SmilChr07G004118
描述	uncharacterized SmilChr07G004118
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	52860199 - 52862848 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994779`
GeneID	`130994779`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994779`
原始查询	`LOC130994779`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03216 (Rhabdo_ncap_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994779

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057775828.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057775828.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775828.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057775828.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057775828.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:52861004`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C79
`Chr7:52861004`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C79
`Chr7:52861134`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B91
`Chr7:52861259`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C45
`Chr7:52861259`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C45
`Chr7:52861553`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr7:52861618`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B47,B61
`Chr7:52861906`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B106
`Chr7:52861946`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	A13,B66,C23
`Chr7:52861946`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A13,B66,C23
`Chr7:52862143`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B121,C3
`Chr7:52862193`	`C`	`CTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	3	B102,C50,D4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775828.1

412 aa

206

412

Rhabdo_ncap_2

PF03216 Rhabdo_ncap_2 68-354 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775828.1`	Pfam	`PF03216`	Rhabdo_ncap_2	Family	68	354	2.5e-66	224.8	Rhabdovirus nucleoprotein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919845.1
TTTTGTATTTCTCCCCCTAAAACCCGCCCTCTCTCTCATACCCGTCGCCTTTTTCCGTCTCTCTCCCTCAAACCGCCGTCTCTCTCACGCTGCCGTTACCAGTCACCGCGCCGCCGCCGCCTTCCTCTGCCTGACGAGTTGAAGTTTGATCAAATGGAGGCGTCGAAGATGTTCTGTAGTGCAAAGGGCATCAAGAATAATAAAGACCCTTTAGAAGAATTCAAGGAGAGCACAATGAAGGAAGAAACCCCAAAATCTAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994779
ATGGAGGCGTCGAAGATGTTCTGTAGTGCAAAGGGCATCAAGAATAATAAAGACCCTTTAGAAGAATTCAAGGAGAGCACAATGAAGGAAGAAACCCCAAAATCTAAGGAAGCAAACACCTACAAAAGCACAAGTGAGACTACCGAATCTGCATCGGAGGACATACCGGATTTAAGTGACGAAGGAGTGTCTCACAATGATTTTAAGGATGGAGCTTGGTCTCAAAAAGATGCTCTCATATTAGAGACATTATCTGAAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775828.1
MEASKMFCSAKGIKNNKDPLEEFKESTMKEETPKSKEANTYKSTSETTESASEDIPDLSDEGVSHNDFKDGAWSQKDALILETLSEDAIIRLGNELLTNLTAGISQRHVGSILLLAFHLHAPGIGNTERIVSVDKLARERDSKLMSLENTVTYKPGKPCTVSEKGTKFEKARAYAFIAASMLKMFTRSSENYCRSWTHILNGHRKFYLIETPITAPKPLGNVLQQIRHHFSVSDIMKATLYRILYNMNEGGNITSVQKFL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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