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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G004122`

染色体: Chr07 坐标: 52886807-52888187 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G004122`
名称	SmilChr07G004122
描述	uncharacterized SmilChr07G004122
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	52886807 - 52888187 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994782`
GeneID	`130994782`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994782`
原始查询	`LOC130994782`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	F-box protein-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842734]; symbol=AT1G64290; hit=AT1G64290; species=arabidopsis; confidence=low
产物	F-box protein-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842734]; symbol=AT1G64290; hit=AT1G64290; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G64290` (AT1G64290) F-box protein-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842734] identity=26.9; qcov=0.888; evalue=5.27e-21; confidence=low
Rice	`Os10g0391200` (OsFbox550) - identity=26.1; qcov=0.333; evalue=1.56e-06; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00646 (F-box); PF12937 (F-box-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994782

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057775831.1`
2	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057775831.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057775831.1`
4	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057775831.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775831.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:52887064`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B12,B20
`Chr7:52887069`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B118,B124
`Chr7:52887073`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B13,B35,B62,B87
`Chr7:52887074`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B8,D10
`Chr7:52887075`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr7:52887079`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C29,C56
`Chr7:52887097`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B81
`Chr7:52887121`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C32,C68
`Chr7:52887157`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B13,B62,B87
`Chr7:52887165`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B21,B68,C26
`Chr7:52887178`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B55,B6,D2
`Chr7:52887236`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B13,B62

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775831.1

427 aa

214

427

F-box

F-box-like

PF00646 F-box 14-49 aa PF12937 F-box-like 15-51 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775831.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	14	49	1.7e-07	31.6	F-box domain
`XP_057775831.1`	Pfam	`PF12937`	F-box-like	Domain	15	51	5.6e-07	29.9	F-box-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919848.1
AGAGATGGGGTCTGCGGCGTCTACCTTACCTGCGGCGTCTACCTTACCAGAATTACCGTCGGAGTTGATCTTCGAGATTCTAAGCCGAACGTCGTTGGAAACCCTAGAACGATGCAAGGCGGTTTCAAAGAGTTGGAAGCACATTATATATGAATCCACTTTTCTCCCTCTCCACTGCCAAAGAACAAATTCCCTCTTCGGCTATTTCTTCCACGACGTCAGACCCTTTAATAAATTTCCGGCGGCGGGGGCGGCGTTGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994782
ATGGGGTCTGCGGCGTCTACCTTACCTGCGGCGTCTACCTTACCAGAATTACCGTCGGAGTTGATCTTCGAGATTCTAAGCCGAACGTCGTTGGAAACCCTAGAACGATGCAAGGCGGTTTCAAAGAGTTGGAAGCACATTATATATGAATCCACTTTTCTCCCTCTCCACTGCCAAAGAACAAATTCCCTCTTCGGCTATTTCTTCCACGACGTCAGACCCTTTAATAAATTTCCGGCGGCGGGGGCGGCGTTGGTATC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775831.1
MGSAASTLPAASTLPELPSELIFEILSRTSLETLERCKAVSKSWKHIIYESTFLPLHCQRTNSLFGYFFHDVRPFNKFPAAGAALVSSAPGAAAAAAINRTWELDYMKILASCDQGILCCERVVQFCDCEDEDCCNNKRFFACKPATSQWQGLPNPKLRCETDAVAIVVVRSTPLRYIIASLYNSGIMQHNCDIFDSEKWAWERIECAAPYGEIVESCRPAITTAGRFFHWLTVSGNVLTLDVKRRSFRCSPLPCDPACK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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