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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G004227`

染色体: Chr07 坐标: 54507877-54516451 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G004227`
名称	SmilChr07G004227
描述	putative disease resistance protein At1g50180
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	54507877 - 54516451 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994804`
GeneID	`130994804`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994804`
原始查询	`LOC130994804`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative disease resistance protein At1g50180
产物	putative disease resistance protein At1g50180
Arabidopsis	`AT5G48620` (AT5G48620) Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834919] identity=32; qcov=1.02; evalue=1.84e-128; confidence=low
Rice	`Os07g0186500` - identity=28.5; qcov=1.03; evalue=2.37e-80; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF18052 (Rx_N); PF23559 (WHD_DRP); PF23598 (LRR_14)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994804

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057775852.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057775852.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775852.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057775852.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057775852.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:54508264`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C77
`Chr7:54508311`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	11	B117,B123,B131,B139,B19,B34,B69,B89,C1,C78,D8
`Chr7:54508330`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B125,C38,C4,C43
`Chr7:54508396`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C2,C27
`Chr7:54508486`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B49,B79
`Chr7:54508488`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B30,B53,B7
`Chr7:54508500`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B30,B36,B7,D3
`Chr7:54508610`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C80
`Chr7:54508615`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B138,B22,C72
`Chr7:54508675`	`GCC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	63	A1,A10,A14,A23,A24,A8,B1,B10,B100,B101,B107,B119,B123,B129,B132,B133,B135,B138,B19,B2,B20,B22,B23,B26,B32,B34,B36,B42,B43,B45,B47,B49,B62,B66,B68,B71,B76,B80,B87,B88,B9,B90,B91,C1,C12,C18,C19,C22,C28,C41,C42,C46,C47,C54,C57,C7,C70,C79,C83,C84,D2,D5,D9
`Chr7:54508753`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B118,B49,C82
`Chr7:54508755`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B118,B49,C82

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775852.1

922 aa

461

922

Rx_N

NB-ARC

WHD_DRP

LRR_14

PF18052 Rx_N 5-91 aa PF00931 NB-ARC 172-333 aa PF23559 WHD_DRP 422-499 aa PF23598 LRR_14 576-886 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775852.1`	Pfam	`PF18052`	Rx_N	Domain	5	91	1.7e-18	67.2	Rx N-terminal domain
`XP_057775852.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	172	333	2.4e-37	128.9	NB-ARC domain
`XP_057775852.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	422	499	2.3e-12	47.5	Disease resistance protein Winged helix domain
`XP_057775852.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	576	886	8.4e-23	81.4	Leucine-rich repeat region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919869.1
CACAACTGCCCCTATAATTAAATATGTAATAATATAATTTAATATTTTGTGCACAAAACAGTTTTTATATTAGTATTGATTTTTTATAAATAAAATTATAAAAATAATAAATGCAAAATTGGTTGAGGAAATGAATGACTGTTTCGTGGGCATGAAGGATGACAGTTAGACTGAAACGCGTATACAATAAATTGGTTTTGCAAGTCAGCTAATAGTAGGGTATAACAATAATAATTAAATATTATGTCGGGAACCATGCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994804
ATGGCGGAAGCAGTGGTGTCGATTGCTCTAGGAACCCTGCGTAGTTTGTTGTTGGAAGACGGCAAGTTTTTATACGGCGTGGGCGATGGAGTGAAGGAGCTCGAGATCCAGCTCAAAGAGATGAAGTGTTTCCTCGAAGATGCTGACAGAAGGCGACATGAAAGCAAAACCATTTTCAATTGGATCTCGGAGATCAAAGAACTTGCGTACAGAGCCGAATCCGCCATTGAAAGACACGCGGCTCGAGTGTCCTCGAGGAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775852.1
MAEAVVSIALGTLRSLLLEDGKFLYGVGDGVKELEIQLKEMKCFLEDADRRRHESKTIFNWISEIKELAYRAESAIERHAARVSSRRSRRGLRRYSCILEEYHSIHQLGSEISKIKSHLGRVTKDMRAYGINNIIDRGEGSALNNNKNWLRKTFPDFEMDDCFVGMEEELKLLESLLVDDKEHRVISVWGMGGSGKTTIARKVYNHIKETRNGCFESFAWVCISQQCQIRSVLEDILTQLRPQKVNENIVGDTLLMGQLC...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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