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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G004354`

染色体: Chr07 坐标: 56083165-56086216 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G004354`
名称	SmilChr07G004354
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-3
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	56083165 - 56086216 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994811`
GeneID	`130994811`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994811`
原始查询	`LOC130994811`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-3
产物	putative late blight resistance protein homolog R1A-3
Arabidopsis	`AT5G43470` (RPP8) Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834367] identity=27.2; qcov=0.983; evalue=5e-65; confidence=low
Rice	`Os10g0358200` - identity=28.1; qcov=0.853; evalue=3.08e-60; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF23559 (WHD_DRP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994811

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057775863.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057775863.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057775863.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775863.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057775863.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:56083442`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A16,C7,C83
`Chr7:56083444`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B9
`Chr7:56083457`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C67
`Chr7:56083458`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B28,C8
`Chr7:56083491`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B66,C71,C79
`Chr7:56083538`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B122,C46,C76
`Chr7:56083538`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B122,C46,C76
`Chr7:56083549`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	D9
`Chr7:56083549`	`T`	`TC`	1bp_insertion	CDS_variant	1	D9
`Chr7:56083563`	`T`	`TCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	26	A22,A8,B117,B122,B29,B46,B48,B57,B94,B97,C10,C15,C38,C46,C47,C48,C52,C55,C59,C7,C72,C76,C82,C9,D2,D5
`Chr7:56083576`	`CTT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	9	A15,B109,B47,C30,C43,C45,C78,C87,D10
`Chr7:56083579`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	9	A15,B109,B47,C30,C43,C45,C78,C87,D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775863.1

895 aa

448

895

NB-ARC

WHD_DRP

PF00931 NB-ARC 169-332 aa PF23559 WHD_DRP 418-488 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775863.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	169	332	4.6e-37	128.0	NB-ARC domain
`XP_057775863.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	418	488	5.8e-16	59.0	Disease resistance protein Winged helix domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XR_009091939.1
TGGAATCATAATACCTGATTAGCTAATTGCCTTCTTTCACCTCTCAAATATTAGTATCAGATATTTTCATTCACACTTCCCATAAATATATATATTATTCAAAGTGTTAATCATGGCGGCTTACGGAGCTCTGGTTTCTCTTATGCATATCATAGATCGCCTTGAAAAACATCCTTCCCCTCCAATTTCTATCCACAAACAGCAAGTTGAATCTCTCACTCAAAATGTGACCTTCTTGCAGGAATTTCTTGATGCTTATA...

XM_057919880.1
TGGAATCATAATACCTGATTAGCTAATTGCCTTCTTTCACCTCTCAAATATTAGTATCAGATATTTTCATTCACACTTCCCATAAATATATATATTATTCAAAGTGTTAATCATGGCGGCTTACGGAGCTCTGGTTTCTCTTATGCATATCATAGATCGCCTTGAAAAACATCCTTCCCCTCCAATTTCTATCCACAAACAGCAAGTTGAATCTCTCACTCAAAATGTGACCTTCTTGCAGGAATTTCTTGATGCTTATA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994811
ATGGCGGCTTACGGAGCTCTGGTTTCTCTTATGCATATCATAGATCGCCTTGAAAAACATCCTTCCCCTCCAATTTCTATCCACAAACAGCAAGTTGAATCTCTCACTCAAAATGTGACCTTCTTGCAGGAATTTCTTGATGCTTATATTTCCCCAGTTGTGGATGACCATGAGGCGGATCCATTGGAGCGTCGCATTGCTGATGCAGTTTATGCAGCTGAGGATGTCATCGAATCCCAAATTGTGCTTCAAATTCATAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775863.1
MAAYGALVSLMHIIDRLEKHPSPPISIHKQQVESLTQNVTFLQEFLDAYISPVVDDHEADPLERRIADAVYAAEDVIESQIVLQIHNRSTIVGKMMSFINLFRALCKCTTIEEDFYQDLQQVIEEMNLIKMEAMEIAATAQLQRKVSSTHAGSSSTVKESIMVGFDDVLLQVLDKLTGGQLSRQIIPIMGMGGIGKTTLARHVFEHALVKEHFDICAWTTISQTYNVRETLSEVLFQASGDWGSNLSGGELGLQLFQYLS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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