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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G004143`

染色体: Chr07 坐标: 53240836-53246553 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G004143`
名称	SmilChr07G004143
描述	UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate--2,6-diaminopimelate ligase MurE homolog, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	53240836 - 53246553 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994819`
GeneID	`130994819`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994819`
原始查询	`LOC130994819`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate--2,6-diaminopimelate ligase MurE homolog, chloroplastic-like
产物	UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate--2%2C6-diaminopimelate ligase MurE homolog%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT1G63680` (MURE) ALBINO OR PALE-GREEN 13 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842672] identity=69.9; qcov=1.03; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os10g0548900` (MURE) - identity=59.8; qcov=0.967; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005524 (ATP binding); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0008360 (regulation of cell shape); GO:0009058 (biosynthetic process); GO:0016881 (acid-amino acid ligase activity); GO:0051301 (cell division)
KEGG	-
Pfam	PF01225 (Mur_ligase); PF02875 (Mur_ligase_C); PF08245 (Mur_ligase_M)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994819

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057775874.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057775874.1`
3	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.20000	`XP_057775874.1`
4	Chloroplast thylakoid	类囊体	0.20000	`XP_057775874.1`
5	Chloroplast thylakoid membrane	类囊体膜	0.20000	`XP_057775874.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:53241228`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B104,B34,B75,C38,D6
`Chr7:53241235`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C86
`Chr7:53241369`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B108
`Chr7:53241384`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B28
`Chr7:53241384`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B28
`Chr7:53241569`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B84
`Chr7:53241569`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B84
`Chr7:53241626`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B12
`Chr7:53241748`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B56
`Chr7:53241856`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B120,C17,C47,C79,C84
`Chr7:53241896`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B103
`Chr7:53241945`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B56,B96

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775874.1

759 aa

380

759

Mur_ligase

Mur_ligase_M

Mur_ligase_C

PF01225 Mur_ligase 249-325 aa PF08245 Mur_ligase_M 338-543 aa PF02875 Mur_ligase_C 566-711 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775874.1`	Pfam	`PF01225`	Mur_ligase	Domain	249	325	4.9e-08	33.9	Mur ligase family, catalytic domain
`XP_057775874.1`	Pfam	`PF08245`	Mur_ligase_M	Domain	338	543	7.5e-60	203.0	Mur ligase middle domain
`XP_057775874.1`	Pfam	`PF02875`	Mur_ligase_C	Domain	566	711	1.3e-25	91.4	Mur ligase, glutamate ligase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XR_009091940.1
CCTATCCATTCCACTGCTACAGCTAAACCCACTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTACAGAGGAGCAAACATGCCCCTCTCTTTCCTCTCTCTCCCACCCTTCCCTCCACCGCCGCTTCTCTCTTACTCCTCAAAGCTCAAACCCACCGCACTCACCCTTCTCCTCAAGCCGCCCCTTCTCTCCGCCTCCACCGCCATCTTCGCCGTCGGCGCCGACGGCAAATACTACCCTACTCCGTCGGATGAGGACCCCCC...

XM_057919891.1
CCTATCCATTCCACTGCTACAGCTAAACCCACTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTACAGAGGAGCAAACATGCCCCTCTCTTTCCTCTCTCTCCCACCCTTCCCTCCACCGCCGCTTCTCTCTTACTCCTCAAAGCTCAAACCCACCGCACTCACCCTTCTCCTCAAGCCGCCCCTTCTCTCCGCCTCCACCGCCATCTTCGCCGTCGGCGCCGACGGCAAATACTACCCTACTCCGTCGGATGAGGACCCCCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994819
ATGCCCCTCTCTTTCCTCTCTCTCCCACCCTTCCCTCCACCGCCGCTTCTCTCTTACTCCTCAAAGCTCAAACCCACCGCACTCACCCTTCTCCTCAAGCCGCCCCTTCTCTCCGCCTCCACCGCCATCTTCGCCGTCGGCGCCGACGGCAAATACTACCCTACTCCGTCGGATGAGGACCCCCCCGAAGCCCCCGAGGACTCCATGCACGGCGTCAACAAGTTCCAGCAAATCCAGCGCCAGGCCTCCCGTGCCCGCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775874.1
MPLSFLSLPPFPPPPLLSYSSKLKPTALTLLLKPPLLSASTAIFAVGADGKYYPTPSDEDPPEAPEDSMHGVNKFQQIQRQASRARKLQEEQYKKDQPTFLKALEETDDIPDSVIDADTGDDPFGEIDKAIALKRREFIKQGLIKPAPKKNAEPEIEVADELEPEEVVDLEEIDELHGLTGDESDEGSADRSEFEVSAGDFASSFDIDFDEFGKTKPRIVEPKFRMSLAELLDESKVVPVSVYGDIEVEISGISHDSRVV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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