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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G004141`

染色体: Chr07 坐标: 53203529-53207576 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G004141`
名称	SmilChr07G004141
描述	transcription factor EGL1-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	53203529 - 53207576 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994838`
GeneID	`130994838`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994838`
原始查询	`LOC130994838`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcription factor EGL1-like
产物	transcription factor EGL1-like
Arabidopsis	`AT5G41315` (GL3) basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834133] identity=44.2; qcov=1.06; evalue=1.87e-166; confidence=medium
Rice	`Os04g0557800` (Pl) - identity=35.4; qcov=0.979; evalue=1.71e-103; confidence=medium
GO	GO:0046983 (protein dimerization activity)
KEGG	-
Pfam	PF00010 (HLH); PF14215 (bHLH-MYC_N); PF22754 (bHLH-TF_ACT-like_plant)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994838

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057775914.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775914.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057775914.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057775914.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057775914.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:53204565`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A25,B86,C29
`Chr7:53205512`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B46
`Chr7:53205733`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B108
`Chr7:53205806`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A15,B105,C52
`Chr7:53205921`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C52
`Chr7:53206084`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A3
`Chr7:53206091`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B95,C74
`Chr7:53206268`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B94,C54,C57,C58
`Chr7:53206658`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C2
`Chr7:53206787`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B8
`Chr7:53206923`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B102,B47,C50,C52
`Chr7:53207363`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B93,D8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775914.1

632 aa

316

632

bHLH-MYC_N

HLH

bHLH-TF_ACT-like_plant

PF14215 bHLH-MYC_N 13-196 aa PF00010 HLH 434-480 aa PF22754 bHLH-TF_ACT-like_plant 554-630 aa

XP_057775915.1

632 aa

316

632

bHLH-MYC_N

HLH

bHLH-TF_ACT-like_plant

PF14215 bHLH-MYC_N 13-196 aa PF00010 HLH 434-480 aa PF22754 bHLH-TF_ACT-like_plant 554-630 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775914.1`	Pfam	`PF14215`	bHLH-MYC_N	Family	13	196	7e-51	173.8	bHLH-MYC and R2R3-MYB transcription factors N-terminal
`XP_057775914.1`	Pfam	`PF00010`	HLH	Domain	434	480	1.9e-12	47.5	Helix-loop-helix DNA-binding domain
`XP_057775914.1`	Pfam	`PF22754`	bHLH-TF_ACT-like_plant	Domain	554	630	1.1e-22	80.6	Plant bHLH transcription factor, ACT-like domain
`XP_057775915.1`	Pfam	`PF14215`	bHLH-MYC_N	Family	13	196	7e-51	173.8	bHLH-MYC and R2R3-MYB transcription factors N-terminal
`XP_057775915.1`	Pfam	`PF00010`	HLH	Domain	434	480	1.9e-12	47.5	Helix-loop-helix DNA-binding domain
`XP_057775915.1`	Pfam	`PF22754`	bHLH-TF_ACT-like_plant	Domain	554	630	1.1e-22	80.6	Plant bHLH transcription factor, ACT-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919932.1
AATACCTAAATCTACCGAAATACTGCTAACTTTATAATTGTAGTACTATACTTTTCTACCCCCACATGGCTATCCCACCAATCCAGATTTGAACCCATGCCCTATTGTTGACGTGTTCAATAAATTAGGTACTTTAAAAATGAAGGTTGAAGAAATGAGTTACTAATGAAGGTTTATTGATTTCACCAAAATATGCTTCGGGCTGTACTAAGTTGAACACTCCATCAAAGGAAGTAATTTTATGTAAGAATCTTGAGGTG...

XM_057919931.1
CCCACCAATCCAGATTTGAACCCATGCCCTATTGTTGACGTGTTCAATAAATTAGGTACTTTAAAAATGAAGGTTGAAGAAATGAGTTACTAATGAAGGTTTATTGATTTCACCAAAATATGCTTCGGGCTGTACTAAGTTGAACACTCCATCAAAGGAAGTAATTTTATGTAAGAATCTTGAGGTGCCATTTCCAGCAAGCTTATATCGAACCAATCCCAGGATTCAGAGCTCTAGTGGTCCAATAATTTAGCCTCCTT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130994838
ATGGCTACTGCAAATCAAAAGGGTGTTCCAGATAATCTCAGAAAGCAGCTTGCTCTTGCAGTTAGAAGCACCCAATGGAGCTATGCAATTTTTTGGTCTTTTTCTGCTGAACAATCTGGGGCATTGGGGTGGAGTGATGGGTACTACAACGGAGATATTAAGACAAGGAAAACGGTTCAAACCGTAGAGCTGAACTCAGATCCGCTGGGATTGCAGAGGAGTGATCAGCTAAGGGAGTTGTTTGAGTCTCTTTCATTAGG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057775914.1
MATANQKGVPDNLRKQLALAVRSTQWSYAIFWSFSAEQSGALGWSDGYYNGDIKTRKTVQTVELNSDPLGLQRSDQLRELFESLSLGETTPQPKRPTAALSPEDLTDTEWYFLVCMSFVFNVGQGLPGRSYAENETIWLRNAHLADTKLFSRSLLAKSASLQTVVCFPHWGGVVELGTTELVPEDRSLIEHIKTSFLESSSDAVINPSHELVYQVLNHSDIPENNLDEVEVYSPDTSSDEFADNVLIEGSSLADGADGEA...

XP_057775915.1
MATANQKGVPDNLRKQLALAVRSTQWSYAIFWSFSAEQSGALGWSDGYYNGDIKTRKTVQTVELNSDPLGLQRSDQLRELFESLSLGETTPQPKRPTAALSPEDLTDTEWYFLVCMSFVFNVGQGLPGRSYAENETIWLRNAHLADTKLFSRSLLAKSASLQTVVCFPHWGGVVELGTTELVPEDRSLIEHIKTSFLESSSDAVINPSHELVYQVLNHSDIPENNLDEVEVYSPDTSSDEFADNVLIEGSSLADGADGEA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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