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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G004189`

染色体: Chr07 坐标: 53907362-53913051 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G004189`
名称	SmilChr07G004189
描述	TOM1-like protein 9
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	53907362 - 53913051 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994841`
GeneID	`130994841`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994841`
原始查询	`LOC130994841`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	TOM1-like protein 9
产物	TOM1-like protein 9
Arabidopsis	`AT4G32760` (AT4G32760) ENTH/VHS/GAT family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829412] identity=48.7; qcov=1.16; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0273700` - identity=43.5; qcov=1.08; evalue=8.36e-148; confidence=medium
GO	GO:0035091 (phosphatidylinositol binding); GO:0043130 (ubiquitin binding); GO:0043328 (protein transport to vacuole involved in ubiquitin-dependent protein catabolic process via the multivesicular body sorting pathway)
KEGG	-
Pfam	PF00790 (VHS); PF03127 (GAT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994841

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057775924.1`
2	Clathrin-coated vesicle	Clathrin-coated vesicle	0.80000	`XP_057775924.1`
3	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	0.60000	`XP_057775924.1`
4	Vesicle	囊泡	0.60000	`XP_057775924.1`
5	Endosome	内体	0.60000	`XP_057775924.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:53908714`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B26
`Chr7:53909067`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B78,C35,C59
`Chr7:53909341`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B129,B42,B43,C36
`Chr7:53909373`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr7:53911545`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B14,B67,C37,D7
`Chr7:53911630`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B53,B66,C19
`Chr7:53911676`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr7:53911698`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B64,C11,C69
`Chr7:53911767`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B132,C6
`Chr7:53911806`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B53,B66,C19
`Chr7:53911853`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A2,B110,B137,B42,B43
`Chr7:53911864`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B77

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775924.1

612 aa

306

612

VHS

GAT

PF00790 VHS 3-116 aa PF03127 GAT 190-262 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775924.1`	Pfam	`PF00790`	VHS	Repeat	3	116	3.7e-29	102.1	VHS domain
`XP_057775924.1`	Pfam	`PF03127`	GAT	Domain	190	262	1.2e-17	64.6	GAT domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919941.1
AAAATAATTAGCTCCACTTTTATATATGCAAATATAGAAGATTCCAATTATTTTTGTCACCCCATAATGCAGCAAAAATCTCAATCCACTTGATAAAAACCTGCGATCTGACGCCCTCGAGAAATTCAATTATTTAAAATTGAAGTTTAATCTCGGAGGGCGTTTGCCGGAATTTCCTGACTGGTTCCGCCGTCGGTGTCGCGGCGGCTCCGGTTGTGATCACTGATTTTTTTAAAAAGCGAAAATGGTGAATGCGATGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994841
ATGGTGAATGCGATGGTGGAAAGAGCTACCAGCGACATGCTGATCGGTCCAGATTGGGCGAGAAACATCGAGATCTGCGATATCTGCACTGCGGATCCCTCACAAGCAAAAGATGTTGTAAAAGGTATAAAGAATCGCCTACGTAGCAGACGGCCCAAAGTCCAGCTCCTTGCCCTGACTCTATTGGAGACCATTGTGAAGAACTGTGGTGATATTGTCCATATGCTTGTTGCTGAGAGGGAGTTGCCACGTGAGATGGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775924.1
MVNAMVERATSDMLIGPDWARNIEICDICTADPSQAKDVVKGIKNRLRSRRPKVQLLALTLLETIVKNCGDIVHMLVAERELPREMVKIVKKKPDFHVKEKILILIYTWQEAFGGPRARYTQYFAAYQELLRLGAVFPRISETSIPVFARPSYPQNIGSSESRLPPANSSVEPEFPTLSPTEIENARDIMDVLAEMLNAIGPDNKEEVNQDLIIDLVEKCRTYKLRVVHLVNSTTDESLLCQGLALNDDLQRVLAKHESI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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