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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G004300`

染色体: Chr07 坐标: 55587052-55592946 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G004300`
名称	SmilChr07G004300
描述	clathrin interactor EPSIN 1-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	55587052 - 55592946 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994845`
GeneID	`130994845`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994845`
原始查询	`LOC130994845`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	clathrin interactor EPSIN 1-like
产物	clathrin interactor EPSIN 1-like
Arabidopsis	`AT5G11710` (AT5G11710) ENTH/VHS family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831043] identity=49.5; qcov=1.06; evalue=4.32e-154; confidence=high
Rice	`Os01g0738600` - identity=41.5; qcov=1.11; evalue=1.78e-115; confidence=medium
GO	GO:0005543 (phospholipid binding); GO:0005768 (endosome); GO:0005886 (plasma membrane); GO:0006897 (endocytosis); GO:0030125 (clathrin vesicle coat); GO:0030276 (clathrin binding)
KEGG	smil04144 (Endocytosis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01417 (ENTH)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994845

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Clathrin-coated vesicle	Clathrin-coated vesicle	1.00000	`XP_057775930.1`
2	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057775930.1`
3	Trans-golgi network	Trans-golgi network	1.00000	`XP_057775930.1`
4	Vesicle	囊泡	0.60000	`XP_057775930.1`
5	Endosome	内体	0.60000	`XP_057775930.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:55589868`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C31
`Chr7:55590858`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr7:55590879`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B133,B16,B89,C5,C71
`Chr7:55591573`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B118,B132
`Chr7:55591578`	`C`	`CG`	1bp_insertion	frameshift_variant	12	A24,B104,B3,B31,B40,B58,B65,C27,C36,C80,D10,D11
`Chr7:55591604`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	A2,B42,B43,C40,C6
`Chr7:55591604`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	5	A2,B42,B43,C40,C6
`Chr7:55591822`	`C`	`CGA`	2bp_insertion	frameshift_variant	13	A1,B1,B102,B12,B13,B33,B35,B60,C3,C31,C60,C64,C66
`Chr7:55591834`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr7:55591856`	`T`	`TCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	6	A14,B60,B93,C20,C24,C37
`Chr7:55592489`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B21
`Chr7:55592499`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775930.1

582 aa

291

582

ENTH

PF01417 ENTH 27-147 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775930.1`	Pfam	`PF01417`	ENTH	Repeat	27	147	1.1e-43	148.9	ENTH domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919947.1
CACACACACACATACTCTTCCTTTAATCCTATTTACTCAAATCATGTTTCTCCATTATTAAATTTCGATGATTCAATTCACTTTCAATTTTGATTTTTCATCAATCTCCATATCCTCATTTCGTCGCCGATTTCCTTTGTTTTTTTCCTTTTCCTCCACTTTTAGCAGAAGCAGCCATGGATTTTATGAAGGTCTTCGATCAAACAGTTCGAGAGATAAAGAGGGAGGTGAATTTGAAGGTGTTGAAGGTTCCAGAGATC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994845
ATGGATTTTATGAAGGTCTTCGATCAAACAGTTCGAGAGATAAAGAGGGAGGTGAATTTGAAGGTGTTGAAGGTTCCAGAGATCGAACAGAAGGTTTTGGATGCAACGGATGATGAACCTTGGGGTCCTCATGGCACAATATTAGCAGAAATAGCTCAGGGCACAAAAAAATACACTGAGTGCCAGATGATTATGAATGTCCTTTGGACAAGATTGGCCGAGACGGGCAAAAATTGGCGCGCTGTCTACAAGGCTTTGTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775930.1
MDFMKVFDQTVREIKREVNLKVLKVPEIEQKVLDATDDEPWGPHGTILAEIAQGTKKYTECQMIMNVLWTRLAETGKNWRAVYKALSVIEYLVSHGSERAVDEIVEHTYQIASLSSFEYVEPGGKDVGINVRKKSETIVALLNDKDKIQEARTKATVNRDKYIGLSSSGLACKSASASLSSRSSDRYRGYGNALDSDASKDNYKGKDQHGEDKYLKTTKSKREPSRSGSKKQDTPVAGASKKSTTASKTNVQTSSSSKKA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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