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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G004194`

染色体: Chr07 坐标: 53986045-53989462 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G004194`
名称	SmilChr07G004194
描述	protein NRT1/ PTR FAMILY 1.2-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	53986045 - 53989462 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994848`
GeneID	`130994848`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994848`
原始查询	`LOC130994848`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein NRT1/ PTR FAMILY 1.2-like
产物	protein NRT1/ PTR FAMILY 1.2-like
Arabidopsis	`AT1G52190` (AT1G52190) Major facilitator superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841649] identity=51; qcov=0.99; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0761500` (P0460E08.29) - identity=46.2; qcov=1; evalue=2.6e-155; confidence=high
GO	GO:0005886 (plasma membrane); GO:0006857 (oligopeptide transport); GO:0022857 (transmembrane transporter activity); GO:0055085 (transmembrane transport)
KEGG	-
Pfam	PF00854 (PTR2); PF07690 (MFS_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994848

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057775935.1`
2	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057775935.1`
3	Vacuole membrane	液泡膜	0.20000	`XP_057775935.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057775935.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775935.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:53986371`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A14,B129,B43,B95,C36
`Chr7:53986422`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A18,B135,B82,C73
`Chr7:53986506`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A14
`Chr7:53986536`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B23,B32,B99,C77,D8
`Chr7:53986564`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C41
`Chr7:53986647`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B61,B88,D3
`Chr7:53986793`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B124,B53
`Chr7:53986794`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B23,B48,B7,B76,C18
`Chr7:53986821`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A1,B109,B59,C19,C86
`Chr7:53986916`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A14
`Chr7:53986935`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2
`Chr7:53986992`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C23

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775935.1

576 aa

288

576

MFS_1

PTR2

PF07690 MFS_1 38-505 aa PF00854 PTR2 94-525 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775935.1`	Pfam	`PF07690`	MFS_1	Family	38	505	1.2e-14	54.7	Major Facilitator Superfamily
`XP_057775935.1`	Pfam	`PF00854`	PTR2	Family	94	525	1.9e-70	238.5	POT family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919952.1
TGTCATCCGTCAGTCCTTAACAGACAAAACCTTCTGCACTTGTTCCAAACCAATTCCATTGTATTTTACTAAAAATATCACATATTTTGAGATGGTTGAAAATTGAAATCTCATGAAATCGACAAAAGATTTTATGTTAACATCATGACTTTGGCAACGTGCGGACGTGAAATCTCTATAATCCCTTCCCACTTCACACTTCTCTCTCACTCTCTCATCAATGGACGATCGGTTGAAGGAGAAGGAAACGATGGTGGAAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994848
ATGGACGATCGGTTGAAGGAGAAGGAAACGATGGTGGAAGAGCCTCTCTTGGAGAGTGCTCAAGAAAAGGGCGGTTTTAGGACTCTCCCCTTCATAATGGGAAATGAGGCACTGGAGAGGATGGCAACTTTCGGGCTGTCGCCAAACATGACTCTGTATTTGATCAATGAGTATCATATGCAGATGACAACTGCGGCGAATGTGTTGTTCATGTGGTCGGCCGCCACGAATTTCATGCCGATTGTTGGAGCTGTTATTGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775935.1
MDDRLKEKETMVEEPLLESAQEKGGFRTLPFIMGNEALERMATFGLSPNMTLYLINEYHMQMTTAANVLFMWSAATNFMPIVGAVIADSYLGRFHTIGFGSIVCLMGVILLWSTAVIPQARPPPCDQSSIVCSPPMIFQFLYLCLSFGLISIGAGGIRSSSLAFGADQLEKKGFHKSPGAKQSYFSWYYASLTLSILVALTCVVYIQENLGWGVGFAIPGVLMLVAVILFFLASPFYVRFKSSSNLITGFAQVAVASFRN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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