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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G004403`

染色体: Chr07 坐标: 56659792-56662088 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G004403`
名称	SmilChr07G004403
描述	putative disease resistance protein At1g50180
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	56659792 - 56662088 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994849`
GeneID	`130994849`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994849`
原始查询	`LOC130994849`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative disease resistance protein At1g50180
产物	putative disease resistance protein At1g50180
Arabidopsis	`AT1G50180` (AT1G50180) NB-ARC domain-containing disease resistance protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841440] identity=37.1; qcov=0.951; evalue=1.56e-87; confidence=medium
Rice	`Os11g0633500` - identity=29.4; qcov=0.965; evalue=2.14e-62; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF13191 (AAA_16); PF18052 (Rx_N); PF23559 (WHD_DRP); PF24883 (NPHP3_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994849

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057775936.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057775936.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775936.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057775936.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057775936.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:56660075`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B19
`Chr7:56660086`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B128,B132
`Chr7:56660092`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B128,B132
`Chr7:56660099`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A11,D8
`Chr7:56660113`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A6,B117,B2,B71,B96
`Chr7:56660168`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	5	B109,B42,B43,B59,B78
`Chr7:56660168`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B109,B42,B43,B59,B78
`Chr7:56660305`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B3
`Chr7:56660428`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B112,B88
`Chr7:56660437`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B67,B68,C27
`Chr7:56660459`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B67,B98,C27
`Chr7:56660488`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B13,B22,B34,C15,C20

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775936.1

570 aa

285

570

Rx_N

AAA_16

NB-ARC

NPHP3_N

WHD_DRP

PF18052 Rx_N 5-86 aa PF13191 AAA_16 164-286 aa PF00931 NB-ARC 173-346 aa PF24883 NPHP3_N 178-286 aa PF23559 WHD_DRP 429-506 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775936.1`	Pfam	`PF18052`	Rx_N	Domain	5	86	2.3e-18	66.8	Rx N-terminal domain
`XP_057775936.1`	Pfam	`PF13191`	AAA_16	Domain	164	286	3.5e-10	41.4	AAA ATPase domain
`XP_057775936.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	173	346	4e-34	118.4	NB-ARC domain
`XP_057775936.1`	Pfam	`PF24883`	NPHP3_N	Domain	178	286	1.3e-05	26.1	Nephrocystin 3, N-terminal
`XP_057775936.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	429	506	1.5e-12	48.1	Disease resistance protein Winged helix domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919953.1
AACAAACAAACAAAATTAGAATTATCGAATGAATCAAGATTATGTGCTTTCTCAGAAAGTTACTCTTTTCTCATAGAAATCTCCAAATCCTAATTTCTCTCTTCCAGAATCCAAATTCTTCGCAATCTCGATTGAAGAATTTGTATTCACCACAACGAGTTCCTTATTCCTCTCTTTATATACTCTCACCAATAGTAAATCGATCGAGTTTGGAATTGTTGCGATGGCAGAAGCAGTGGTGTCGACTGCTCTAGCAACCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994849
ATGGCAGAAGCAGTGGTGTCGACTGCTCTAGCAACCTTGCGCAATTTGTTGGTGGAAGAAGCAATGTTTTTGTATGGCGTGGGTGACAAAGTGAGGGAGCTCAAGATGCAGCTCAAAGAGATGAAGTGTCTTCTCAAAGATGCCGATAGAAGACGACATGGAAGCGAAACCATTTTGAATTGGATCTCAGAGATCAAAGATCTTGTGTACAGAGCCGAAGCTGCCATGGAAAGACACGCAGCTTATCAAGTGTTGGCAAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775936.1
MAEAVVSTALATLRNLLVEEAMFLYGVGDKVRELKMQLKEMKCLLKDADRRRHGSETILNWISEIKDLVYRAEAAMERHAAYQVLARRRRGLRQLIRRYSCILEEGYSLHQLGSEISQIKSDLARVTEAMRAYGIKNIIDRGESSSTNDRARKSFPEFEIGECFVGMEEELMQLGNLLRQDNEERVISVWGMGGSGKTTIAKKLYNETKTSFDLCAWVCITQQCQSFQSVWNDVLKQLEHQSRKGVSDEPQQIREDVVPN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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