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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G004271`

染色体: Chr07 坐标: 55120394-55125917 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G004271`
名称	SmilChr07G004271
描述	uncharacterized SmilChr07G004271
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	55120394 - 55125917 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994854`
GeneID	`130994854`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994854`
原始查询	`LOC130994854`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ATP-dependent protease La (LON) domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817117]; symbol=AT2G25740; hit=AT2G25740; species=arabidopsis; confidence=high
产物	ATP-dependent protease La (LON) domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817117]; symbol=AT2G25740; hit=AT2G25740; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G25740` (AT2G25740) ATP-dependent protease La (LON) domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817117] identity=50.7; qcov=1.03; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os05g0521500` - identity=45.4; qcov=1.02; evalue=5.03e-164; confidence=high
GO	GO:0016567 (protein ubiquitination); GO:0031464 (Cul4A-RING E3 ubiquitin ligase complex)
KEGG	-
Pfam	PF02190 (LON_substr_bdg); PF03226 (Yippee-Mis18)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994854

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057775941.1`
2	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057775941.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057775941.1`
4	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057775941.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775941.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:55120590`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B127,C40
`Chr7:55122147`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr7:55122275`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	D1
`Chr7:55122275`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D1
`Chr7:55123714`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C15
`Chr7:55124040`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A14,B36,C17,C29,C77
`Chr7:55124113`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775941.1

539 aa

270

539

LON_substr_bdg

Yippee-Mis18

PF02190 LON_substr_bdg 97-429 aa PF03226 Yippee-Mis18 434-534 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775941.1`	Pfam	`PF02190`	LON_substr_bdg	Family	97	429	4.2e-26	92.8	ATP-dependent protease La (LON) substrate-binding domain
`XP_057775941.1`	Pfam	`PF03226`	Yippee-Mis18	Domain	434	534	3.7e-07	31.0	Yippee zinc-binding/DNA-binding /Mis18, centromere assembly

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919958.1
TTTCTAGCACCTGCTGCAAACGTATTAATCACCACTCTCTAGTCTCTACAGCTGCAGCAAACACAACACAAAACTCCCATTTTCTTTTTTCTTTTTTCCATTTTCCTTTTTCCTTTTTCCCGCACTCTCGCTCCTCAAAAACAAGCATGAACAATCGGAGTTGGATAGAGACTAACCCTATGGCAAACGACTCGATCTCGGAGAGCGAGAGGCAACAGATCGAGCAGATTATGGAGCTCGAATTCGAGGAATTGGAAGTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994854
ATGAACAATCGGAGTTGGATAGAGACTAACCCTATGGCAAACGACTCGATCTCGGAGAGCGAGAGGCAACAGATCGAGCAGATTATGGAGCTCGAATTCGAGGAATTGGAAGTCGAAGAAGTGGAGGACGAGGAATCGTCTGACGATGAGTATCGCCGTGTTTCTGCAGGAGCTTCTGCATCTGGCGAATATACATATGATACCAATTTAGTCACCTTGCATTCGTATCTCGGTGATGTTGAAGACACTCACAGTAAGCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775941.1
MNNRSWIETNPMANDSISESERQQIEQIMELEFEELEVEEVEDEESSDDEYRRVSAGASASGEYTYDTNLVTLHSYLGDVEDTHSKLAFLDGGAVLTLPLFYLEGVVLFPEATLPLRVVSPNFIAGVERAMAHVDARYTIGVVRVYWDPNNGRRRLSTTGTTAEIRQYRKLEDGSVNIVARGQQRFRLKRRWIDVEGSHCGEVYIIQEDVPLRTPREAVGKLDPLRNYQATIHHSCEEGNDSDVMSEGSFESELSSTERR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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