当前解析结果
SmilChr07G004369| 统一新 Gene ID | SmilChr07G004369 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G004369 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr07G004369 |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 56240618 - 56247178 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130994867 |
|---|---|
| GeneID | 130994867 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130994867 |
| 原始查询 | LOC130994867 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os11g0671600; species=rice; confidence=low |
| 产物 | hit=Os11g0671600; species=rice; confidence=low |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | Os11g0671600- identity=32.6; qcov=0.552; evalue=4.83e-24; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130994867 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057775961.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057775961.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057775961.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057775961.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.00000 | XP_057775961.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:56241398 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B130,B80 |
Chr7:56241615 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B20,B48,B55 |
Chr7:56241941 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D10 |
Chr7:56241942 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D10 |
Chr7:56241949 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B93 |
Chr7:56241950 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D10 |
Chr7:56241969 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D10 |
Chr7:56241978 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A9,B25,D10 |
Chr7:56241986 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A9,B25,D10 |
Chr7:56241994 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D10 |
Chr7:56246127 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B113 |
Chr7:56246201 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A14,C26,C35,C36,C39 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。