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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G004329`

染色体: Chr07 坐标: 55857972-55859889 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G004329`
名称	SmilChr07G004329
描述	uncharacterized SmilChr07G004329
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	55857972 - 55859889 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994882`
GeneID	`130994882`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994882`
原始查询	`LOC130994882`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	OsFbox490; symbol=OsFbox490; hit=Os09g0449600; species=rice; confidence=low
产物	OsFbox490; symbol=OsFbox490; hit=Os09g0449600; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT5G50220` (AT5G50220) F-box family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835087] identity=24; qcov=0.73; evalue=7.65e-08; confidence=weak
Rice	`Os09g0449600` (OsFbox490) - identity=30.4; qcov=0.477; evalue=2.81e-10; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00646 (F-box); PF08268 (FBA_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994882

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057775986.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057775986.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057775986.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775986.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057775986.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:55858099`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	17	A2,A4,B12,B123,B140,B32,B39,B54,B69,B79,B81,C15,C22,C40,C54,C72,C74
`Chr7:55858103`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	17	A2,A4,B12,B123,B140,B32,B39,B54,B69,B79,B81,C15,C22,C40,C54,C72,C74
`Chr7:55858112`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr7:55858115`	`T`	`TTC`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B3
`Chr7:55858115`	`T`	`TTC`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B3
`Chr7:55858132`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C56,C78,C87
`Chr7:55858135`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B72,C61
`Chr7:55858170`	`G`	`GCC`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	C61
`Chr7:55858170`	`G`	`GCC`	2bp_insertion	CDS_variant	1	C61
`Chr7:55858174`	`GAT`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C61
`Chr7:55858174`	`GAT`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C61
`Chr7:55858220`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B103,B137,B34

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775986.1

400 aa

200

400

F-box

FBA_3

PF00646 F-box 57-97 aa PF08268 FBA_3 144-379 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775986.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	57	97	1.1e-06	29.0	F-box domain
`XP_057775986.1`	Pfam	`PF08268`	FBA_3	Repeat	144	379	2e-07	31.1	F-box associated beta propeller domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057920003.1
TCATTTACTCGACCGCCGCTTTCTAGTTTCTACACAGTTCACATTCACAGAAAATAGAAAAGCTGAAATGCTTCGACGGAAAATCGCCTCCCACAAGCCGCCGCCTCCTCGCCGCTGCTGCACTGACGGCAGCGATTCGGATCCCCATTCCGACATTCTTAGTAGAGAATCGATGATAGAGATTAGAAGTCGGGCTTATTATTTCCGGAGGTGTAAAAAGGGGATGCCAACAAACATAGAGTCCCTCTCCACCGACCTAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994882
ATGCTTCGACGGAAAATCGCCTCCCACAAGCCGCCGCCTCCTCGCCGCTGCTGCACTGACGGCAGCGATTCGGATCCCCATTCCGACATTCTTAGTAGAGAATCGATGATAGAGATTAGAAGTCGGGCTTATTATTTCCGGAGGTGTAAAAAGGGGATGCCAACAAACATAGAGTCCCTCTCCACCGACCTATTGTTTGAAATCCTCCTCCGTTTGCCGGCCGATCATCTCTACGAGAGAGCAAGGCTCGTCTGCCAGCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775986.1
MLRRKIASHKPPPPRRCCTDGSDSDPHSDILSRESMIEIRSRAYYFRRCKKGMPTNIESLSTDLLFEILLRLPADHLYERARLVCQRWYHIIHSHAFISAQMHSSTYGLLLSPLNWSNTLPLYVTADADGGIHTSDLNHISKLEVLATCNGLALEFDFKDRLLRLVNPAKKQSLLLPRLSRGATYAWPTYGFAYSAASLAYKVVLHYLQTDYCLHVLTVGVDESWRHVEVHHLLGHVRPCLLNKTPLTSEGFVHWGRGRY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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