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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G004314`

染色体: Chr07 坐标: 55701722-55704595 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G004314`
名称	SmilChr07G004314
描述	uncharacterized SmilChr07G004314
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	55701722 - 55704595 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994886`
GeneID	`130994886`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994886`
原始查询	`LOC130994886`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os07g0205500; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os07g0205500; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT1G55360` (AT1G55360) tRNA-splicing ligase (DUF239) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841982] identity=40.7; qcov=0.972; evalue=6.14e-89; confidence=medium
Rice	`Os07g0205500` - identity=40.3; qcov=0.957; evalue=1.94e-92; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03080 (Neprosin); PF14365 (Neprosin_AP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994886

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	0.60000	`XP_057775990.1`
2	Vacuole	液泡	0.40000	`XP_057775990.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057775990.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775990.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057775990.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:55701801`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B56,B96
`Chr7:55701804`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122
`Chr7:55701903`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B66,C1
`Chr7:55701921`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	C14,C82
`Chr7:55701921`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	2	C14,C82
`Chr7:55702099`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B122,B60
`Chr7:55702102`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B100,B111
`Chr7:55702131`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B60
`Chr7:55703055`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B1,B33,C26,C39,C8
`Chr7:55703077`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr7:55703620`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B133,B16,B89
`Chr7:55703639`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C27

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775990.1

394 aa

197

394

Neprosin_AP

Neprosin

PF14365 Neprosin_AP 33-136 aa PF03080 Neprosin 177-387 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775990.1`	Pfam	`PF14365`	Neprosin_AP	Family	33	136	1.1e-29	104.1	Neprosin activation peptide
`XP_057775990.1`	Pfam	`PF03080`	Neprosin	Family	177	387	8.6e-64	215.5	Neprosin

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057920007.1
TTAAAAGTGCAAAAACTGCAGTATTCAAGCACAATTCTATGGAAATATTTGTCTCCAAACCAAAAAAGAAAATTTACTTAGTTTCTACACATTACTTGAACAGAAACAAGATTTAATTTAAGAATCTTTGAAGCCACCTTGTTTTTTTGGCAAGAGGAGAAAAAACACTAATTCACTTAGAAAATGGGATTCAAATATCTGGTGATTTTAGTGTCATTACAAACTGTTTTATGCAGCAGAATGGTGGAAACTACCCTTCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994886
ATGGGATTCAAATATCTGGTGATTTTAGTGTCATTACAAACTGTTTTATGCAGCAGAATGGTGGAAACTACCCTTCCCAAAAACCATGCAGTTTTGAGCATTCAGAGTGAAGATGGAGATATCATTGATTGCATAGATATCTACAAGCAGCCAGCTTTTGATCATCCAGCATTAAGGGATCACAAAATCCAGATGAGCCCGAGCCAGAGCCAGAGCCCGAGCCACCACGTAGAGATGCAGCCGGACGCGAGCAGAGGCTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775990.1
MGFKYLVILVSLQTVLCSRMVETTLPKNHAVLSIQSEDGDIIDCIDIYKQPAFDHPALRDHKIQMSPSQSQSPSHHVEMQPDASRGSPKTVTTQIWHKNGSCPKGTIPVRRAEGKHLPNYGRKRAVFSHHSSQANDSNGQHWLRHNYSLAILHTEGYAYIGGKADIKVFTPYVELDDEYSTSRVALKTGPYYDFEAMESGWQVNPTVYGDRQTRLFVYWTTDAAKETGCFDLTCPGFVQTSNEIALGAAIYPISDPNGLP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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