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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G004336`

染色体: Chr07 坐标: 55915666-55917955 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G004336`
名称	SmilChr07G004336
描述	putative F-box protein At3g52320
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	55915666 - 55917955 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994890`
GeneID	`130994890`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994890`
原始查询	`LOC130994890`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative F-box protein At3g52320
产物	putative F-box protein At3g52320
Arabidopsis	`AT3G20710` (AT3G20710) F-box family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821619] identity=24.6; qcov=0.469; evalue=1.58e-08; confidence=weak
Rice	`Os09g0448100` (OsFbox489) - identity=28; qcov=0.56; evalue=3.77e-10; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00646 (F-box); PF08268 (FBA_3); PF12937 (F-box-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994890

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057775993.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057775993.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057775993.1`
4	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057775993.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775993.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:55915835`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	7	B10,B18,B32,B97,C41,C49,C54
`Chr7:55915947`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B70
`Chr7:55915982`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B61,B95,D3
`Chr7:55916090`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B114,B40,C62
`Chr7:55916100`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	8	B122,B78,C2,C23,C32,C49,C68,C82
`Chr7:55916197`	`A`	`AGT`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	C64,C66
`Chr7:55916197`	`A`	`AGT`	2bp_insertion	CDS_variant	2	C64,C66
`Chr7:55916224`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B18
`Chr7:55916266`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B105,B33,C10,C13
`Chr7:55916349`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B15,C11,C30,C38,C69
`Chr7:55916405`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B36,C62
`Chr7:55916405`	`G`	`GT`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B36,C62

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775993.1

382 aa

191

382

F-box-like

F-box

FBA_3

PF12937 F-box-like 23-60 aa PF00646 F-box 24-62 aa PF08268 FBA_3 108-230 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775993.1`	Pfam	`PF12937`	F-box-like	Domain	23	60	3.7e-07	30.5	F-box-like
`XP_057775993.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	24	62	1.4e-07	31.8	F-box domain
`XP_057775993.1`	Pfam	`PF08268`	FBA_3	Repeat	108	230	9.9e-08	32.1	F-box associated beta propeller domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057920010.1
GGTTTTATATATTGATTTCTTTCTTGCATTCCAGACGATGCATCACTTGGAGATCAAGTTTTAATTAGTTGACTTTTGTTTTCCAAAATTCTATTAGTTTAGAGAATTAAATTACGTAATTTTCTTGCTTTGGGAGCTTGGAGACTTGCGGCTGGCATCAAGAAATTGGGACTTCTTGTTTTCAAGTGATGTTACACATCAGAAGTCGGGCTTATTATGTCCGGAGGCGTAAAAAGGAGAGGCCAACAAATATGAAGTCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994890
ATGTTACACATCAGAAGTCGGGCTTATTATGTCCGGAGGCGTAAAAAGGAGAGGCCAACAAATATGAAGTCCCTCCCCAAAGAGCTATTGTTCGAAATCCTCCTCCGTGTCCCGGCCGATCATCTCTACGAGAGAGCGAGGCTCGTGTGCCGGCGGTGGTACCACATTATCCATTCTCATGCCTTCATCAACGCGCAGATGCACGGTGCTACCTATGGACTCCTCCTATCACCCGTAAAGTATAATACTCTGCCACTTTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775993.1
MLHIRSRAYYVRRRKKERPTNMKSLPKELLFEILLRVPADHLYERARLVCRRWYHIIHSHAFINAQMHGATYGLLLSPVKYNTLPLYVTADAYGGIHTSELNHISKLGVLATCNGLILEMKEKGYRLPRLVIVNPATKQSFLLPPLPTGVAYSLDQYGFAYSAASLAYKVIAPYTVRHSPLDLEIDYGLRVLTVGVDESWRQVEIHHLPDHVRPLFFKRGPVTSEGFLHWGRGKCCATLDVETEIITLSEAPGQYHESRY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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