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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G004352`

染色体: Chr07 坐标: 56067997-56070217 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G004352`
名称	SmilChr07G004352
描述	putative F-box protein At3g52320
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	56067997 - 56070217 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994891`
GeneID	`130994891`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994891`
原始查询	`LOC130994891`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative F-box protein At3g52320
产物	putative F-box protein At3g52320
Arabidopsis	`AT3G22720` (AT3G22720) F-box/associated interaction domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821843] identity=28.3; qcov=0.538; evalue=4.42e-07; confidence=low
Rice	`Os09g0448100` (OsFbox489) - identity=23.2; qcov=0.793; evalue=1.37e-07; confidence=weak
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00646 (F-box); PF08268 (FBA_3); PF12937 (F-box-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994891

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057775994.1`
2	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057775994.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057775994.1`
4	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057775994.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775994.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:56068982`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B18
`Chr7:56068982`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B18
`Chr7:56069008`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A11
`Chr7:56069017`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr7:56069076`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B119,B58
`Chr7:56069082`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B54
`Chr7:56069084`	`G`	`GAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	B119,B54
`Chr7:56069084`	`G`	`GAT`	2bp_insertion	CDS_variant	2	B119,B54
`Chr7:56069114`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C19,C75
`Chr7:56069131`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B26
`Chr7:56069142`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B58,B89,C27
`Chr7:56069153`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B74

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775994.1

381 aa

190

381

F-box-like

F-box

FBA_3

PF12937 F-box-like 23-60 aa PF00646 F-box 24-62 aa PF08268 FBA_3 128-245 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775994.1`	Pfam	`PF12937`	F-box-like	Domain	23	60	3.7e-07	30.5	F-box-like
`XP_057775994.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	24	62	1.7e-07	31.6	F-box domain
`XP_057775994.1`	Pfam	`PF08268`	FBA_3	Repeat	128	245	1.7e-07	31.3	F-box associated beta propeller domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057920011.1
GGTTTTATATATTGATTTCTTTCTTGCATTCCAGACGATGCATCACTTGGAGATCAAGTTTTAATTAGTTGACTTTTGTTTTCCAAAATTCTATTAGTTTAGAGAATTAAATTACGTAATTTTCTTGCTTTGGGAGCTTGGAGACTTGCGGCTGGCATCAAGAAATTGGGACTTCTTGTTTTCAAGTGATGTTACACATCAGAAGTCGGGCTTATTATGTCCGGAGGCGTAAAAAGGAGAGGCCAACAAATATGAAGTCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994891
ATGTTACACATCAGAAGTCGGGCTTATTATGTCCGGAGGCGTAAAAAGGAGAGGCCAACAAATATGAAGTCCCTCCCCAAAGAGCTATTGTTCGAAATCCTCCTCCGTGTCCCGGCCGATCATCTCTACGAGAGAGCGAGGCTCGTGTGCCGGCGGTGGTACCACATTATCCATTCTCATGCCTTCATCAACGCGCAGATGCACGGTGCTACCTATGGACTCCTCCTATCACCCGTAAAGGGTAATACACTGCCACTTTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775994.1
MLHIRSRAYYVRRRKKERPTNMKSLPKELLFEILLRVPADHLYERARLVCRRWYHIIHSHAFINAQMHGATYGLLLSPVKGNTLPLYVTADANGGIHKSELNHISKLGVLATCNGLVLELEDGDYHPRRLVIVNPATKQSFLLPPLPTGVAYRLHQYGFAYSAASLAYKVIAPYSIHHSQPRLQIDYGLDVLTVGVDESWRHVDVHHLPDHVRTFFDKAPLTSEGFLHWGSGRYCATMDVETEIITLSEAPGQYHESRYT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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