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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G004215`

染色体: Chr07 坐标: 54342933-54345103 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G004215`
名称	SmilChr07G004215
描述	GATA transcription factor 12-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	54342933 - 54345103 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994903`
GeneID	`130994903`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994903`
原始查询	`LOC130994903`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	GATA transcription factor 12-like
产物	GATA transcription factor 12-like
Arabidopsis	`AT5G25830` (GATA12) GATA transcription factor 12 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832652] identity=50.9; qcov=0.958; evalue=3.06e-94; confidence=high
Rice	`Os01g0745700` (OsGATA6) - identity=48.3; qcov=1.05; evalue=6.13e-87; confidence=high
GO	GO:0005634 (nucleus); GO:0008270 (zinc ion binding); GO:0043565 (sequence-specific DNA binding); GO:0045893 (positive regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	PF00320 (GATA)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994903

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057776017.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057776017.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057776017.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057776017.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057776017.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:54343173`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2
`Chr7:54343202`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2
`Chr7:54343267`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	85	A13,A18,A2,A21,A25,A3,A4,A9,B101,B102,B104,B106,B108,B110,B111,B113,B114,B117,B124,B133,B136,B137,B14,B140,B15,B19,B20,B24,B26,B27,B29,B32,B33,B36,B47,B50,B51,B52,B53,B54,B56,B61,B63,B66,B70,B77,B83,B87,B9,B93,B95,B96,B99,C1,C12,C13,C15,C18,C22,C23,C26,C29,C32,C38,C42,C46,C48,C50,C58,C59,C60,C65,C68,C71,C74,C76,C77,C79,C81,C83,C85,C87,D3,D4,D5
`Chr7:54343271`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	86	A13,A18,A2,A21,A25,A3,A4,A9,B101,B102,B104,B106,B108,B110,B111,B113,B114,B117,B124,B133,B136,B137,B14,B140,B15,B19,B20,B24,B26,B27,B29,B32,B33,B36,B45,B47,B50,B51,B52,B53,B54,B56,B61,B63,B66,B70,B77,B83,B87,B9,B93,B95,B96,B99,C1,C12,C13,C15,C18,C22,C23,C26,C29,C32,C38,C42,C46,C48,C50,C58,C59,C60,C65,C68,C71,C74,C76,C77,C79,C81,C83,C85,C87,D3,D4,D5
`Chr7:54343341`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B128
`Chr7:54343359`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B65,D10,D6
`Chr7:54343374`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A13,B26,C23,C48
`Chr7:54343392`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr7:54343401`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B113,B16,C83
`Chr7:54343458`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,B120
`Chr7:54343479`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr7:54343539`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C39

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057776017.1

355 aa

178

355

GATA

PF00320 GATA 242-276 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057776017.1`	Pfam	`PF00320`	GATA	Domain	242	276	4.3e-15	55.7	GATA zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057920034.1
CTCCCTGTCCCCTTCTAACGCAAATAAACCCCTCTCCTCACTTCTCTCCCTCAAAACTTCACTCTCTCTCTCTCTCTCTCCCTCTCCACAAACACACACACATACTCTTTTCCCCCATTTTTCTCTACACTTTCTCTCACTCACTCTCTCTCTCTCTCCCATCCTTCATTCCCTGCGTGTTGTGTGTGTGTGGAGAAGAAGAAGAAGAAAAAAAAAATAATCCCGATGGAAGCCGCCCCCGAATTCTTCGAAGCCGGCTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994903
ATGGAAGCCGCCCCCGAATTCTTCGAAGCCGGCTACTACGACGCCGTCTTCACGCCGGAGAAGCGCCTCTCCGACGCCAAGAACGGCGACCATTTCGCCGTCGACGACCTCCTCGACCTCCCCAACGACGACACTCTCGACGCGGCCGTGACCGGGCCCGCAGCCTCCGCCGACTCCTCCCCCGTCGCCTCGGCCGTCGTCGCCACCCCCGAGCCGCATTTTTCCGCCGCGGACATCGGTGGCCCCCGCGTCGCCGCCGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057776017.1
MEAAPEFFEAGYYDAVFTPEKRLSDAKNGDHFAVDDLLDLPNDDTLDAAVTGPAASADSSPVASAVVATPEPHFSAADIGGPRVAAGGCGGGHFSGELCVPYDDLAELEWLSNFVEESFSSEDLQKLQLIQGMKARNDNVSGPIQYPLQPETTATGPTLRPELSVPAKARSKRSRAAPGNWTSRLLVVAPTSPVATNAVPAMSSSSESDASAATARKAAKPAAQKKKEGHDGSSGGGEGRKCLHCATDKTPQWRTGPMGP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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