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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID,以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因,再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。
示例

当前解析结果

SmilChr07G004418

染色体: Chr07 坐标: 56773981-56777951 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene IDSmilChr07G004418
名称SmilChr07G004418
描述mitochondrial carrier protein CoAc1-like
染色体 / SeqIDChr07 / NC_080393.1
坐标与链方向56773981 - 56777951 / -

ID 对照

NCBI Gene IDLOC130994906
GeneID130994906
locus_tag-
NCBI NameLOC130994906
原始查询LOC130994906

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述mitochondrial carrier protein CoAc1-like
产物mitochondrial carrier protein CoAc1-like
ArabidopsisAT1G14560 (AT1G14560)
Mitochondrial substrate carrier family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838018]
identity=67.5; qcov=0.989; evalue=2.74e-159; confidence=high
RiceOs01g0708900
-
identity=68.7; qcov=0.888; evalue=2.23e-155; confidence=high
GOGO:0055085 (transmembrane transport)
KEGG-
PfamPF00153 (Mito_carr)
InterPro-
eggNOG-
NRGeneID:130994906

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank定位位置中文ScoreProtein ID
1 Mitochondrion 线粒体 1.00000 XP_057776023.1
2 Mitochondrion membrane 线粒体膜 1.00000 XP_057776023.1
3 Mitochondrion inner membrane 线粒体内膜 1.00000 XP_057776023.1
4 Nucleus 细胞核 0.00000 XP_057776023.1
5 Chromosome 染色体 0.00000 XP_057776023.1

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

该基因暂未检索到已上线的精选 EMS CDS / LoF 突变,或 EMS 突变库仍在构建。

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057776023.1
349 aa
N
1
174
349
Mito_carr
Mito_carr
Mito_carr
C
PF00153 Mito_carr 40-127 aa PF00153 Mito_carr 136-237 aa PF00153 Mito_carr 241-334 aa
Protein ID 来源 结构域编号 结构域名称 类型 起始 aa 终止 aa E-value Score 说明
XP_057776023.1 Pfam PF00153 Mito_carr Repeat 40 127 7.1e-73 241.2 Mitochondrial carrier protein
XP_057776023.1 Pfam PF00153 Mito_carr Repeat 136 237 7.1e-73 241.2 Mitochondrial carrier protein
XP_057776023.1 Pfam PF00153 Mito_carr Repeat 241 334 7.1e-73 241.2 Mitochondrial carrier protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA(仅基因区域)

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA
XM_057920040.1
CTAAATAATTAAAAAAAAAAAACCTTTTTATTTTGAATCACATGTCTCTTGTTTCGGCGGTTTGTTAGGCCTCAATTTTTCCGCCACCAATTTCAATTATTTTCTTTTACCAGTATTTCGCCTAAAATCTCTCTAGTCAAGCCAACGATACCTTCCAGGAACCGAGGAAATAGGAGGAAAATTAGAAATTCAATTTGTCATAAACAATTCCATTTTTGGAAGACCAATTCAAATTGGGTTTTTATCTTTTCAAGAAAAGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA
LOC130994906
ATGATGAATTCATCACAGGGTTCTACTCTGTCATCAAATGTGACTGGATTTGCAGGAGCAGCCTCTGCTCACAGGGAGGCTCACAGAGAGGCCAAATATATAGATACAGTTCCTGTGTATGTAAAGGAGCTGATTGCTGGTGGTGCAGCTGGTGGATTTGCTAAGACGGCCGTTGCCCCGTTGGAACGAACTAAGATACTTCTGCAGACTAGAACGCAAGGTTTTCAGTCTCTAGGGGTTTACCCCTCTTTGAAGAAGCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA
XP_057776023.1
MMNSSQGSTLSSNVTGFAGAASAHREAHREAKYIDTVPVYVKELIAGGAAGGFAKTAVAPLERTKILLQTRTQGFQSLGVYPSLKKLLKHEGVAGFYKGNGASVLRIVPYAALHFMAYEQYRSRILDNYSALGTGPVVDLLAGSAAGGTAVLCTYPLDLARTKLAYQVVDTRSNLQHGARQFNANPSYNGIGDVFKRVYKEGGVRGLYRGIGPTLIGILPYAGLKFYVYEELKRHVPEEHQKSIVMRLSCGAIAGVLGQT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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