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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G004192`

染色体: Chr07 坐标: 53947162-53950533 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G004192`
名称	SmilChr07G004192
描述	U-box domain-containing protein 25
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	53947162 - 53950533 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994910`
GeneID	`130994910`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994910`
原始查询	`LOC130994910`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	U-box domain-containing protein 25
产物	U-box domain-containing protein 25
Arabidopsis	`AT5G11550` (AT5G11550) ARM repeat superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831027] identity=47.9; qcov=1.04; evalue=2.89e-74; confidence=high
Rice	`Os05g0559350` - identity=35.9; qcov=1.13; evalue=9.06e-24; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF25598 (ARM_PUB)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994910

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057776027.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057776027.1`
3	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057776027.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057776027.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057776027.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:53947574`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A13,B124,D4
`Chr7:53949485`	`ACT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C40
`Chr7:53949485`	`ACT`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C40
`Chr7:53949495`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B66
`Chr7:53949525`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B129,B14,B42,B43,C36
`Chr7:53949712`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B124,B71,B88
`Chr7:53949741`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48
`Chr7:53949751`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B124,B71
`Chr7:53949768`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B129,B42,B43
`Chr7:53949778`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr7:53949782`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D8
`Chr7:53949897`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C71

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057776027.1

324 aa

162

324

ARM_PUB

PF25598 ARM_PUB 157-316 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057776027.1`	Pfam	`PF25598`	ARM_PUB	Repeat	157	316	2.5e-21	77.1	Plant U-box protein ARM repeat region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057920044.1
AAAATCGAATCAGATAATTTAATAGAATAATTTGGGAATCAATACATATTCATCAAATCTCTCAAAATATATATATTCATCAAAATTCTCCTAAATTTCTATTCACAGCCCACATTCGATAAAAATAAACTGAATTGGGCCCGGCCCACTATCTACAGCCCGAAAATCATCCAACATTTCAATCAATGAAGCCCGATTTGGAAGCATCGCTTTCTTGTCAGTGAACAAGTCCCCACCTCTCCTCTTTACTGATCTCTCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994910
ATGAAAACAAACCAACCGAAGCTCAAAACCGCCCCACGCAGCCAGCTGTTTTCGTGCGGATTCTTCCGCCACTGCGCTCAAACAGTCCTCAGCCCCACCAGCTCCACCCCGCCGCCCCTCCCTCAGGCCGCGCCTCCGCCTCCGCCGCCGCAGCGGCCGCAGCCGGAGTCCTCCTCCTCCTCCTCTTCCAACACCTCCCAGAGCTTCACCCAGTGGCGATTCCCACTCTCCAACTCGCCCATGGGCCAACCGTATTCCCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057776027.1
MKTNQPKLKTAPRSQLFSCGFFRHCAQTVLSPTSSTPPPLPQAAPPPPPPQRPQPESSSSSSSNTSQSFTQWRFPLSNSPMGQPYSQPKPESEPEPAPDPNPDADAPPLDGAALEELFREAELRFGSGSESGRVGAVHLLERSLVPNPRSAADGCPTAVLGGVVACLREGVARKAASKVLLALCLVEENRRTAVGAGAVAAVVEALADAEGAVAERSLAALELLCTTPEGAEGVRAHALAVPMMVQWMGGMEGGRGKEHA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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