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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G004163`

染色体: Chr07 坐标: 53504115-53508674 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G004163`
名称	SmilChr07G004163
描述	short-chain dehydrogenase TIC 32, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	53504115 - 53508674 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994917`
GeneID	`130994917`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994917`
原始查询	`LOC130994917`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	short-chain dehydrogenase TIC 32, chloroplastic-like
产物	short-chain dehydrogenase TIC 32%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT4G23420` (AT4G23420) NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828441] identity=71.2; qcov=1; evalue=6.01e-167; confidence=high
Rice	`Os09g0570300` - identity=67.1; qcov=0.984; evalue=2.86e-157; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00106 (adh_short); PF01370 (Epimerase); PF08659 (KR); PF13561 (adh_short_C2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994917

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	0.60000	`XP_057776039.1`
2	Mitochondrion	线粒体	0.40000	`XP_057776039.1`
3	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.20000	`XP_057776039.1`
4	Lipid droplet	脂滴	0.20000	`XP_057776039.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057776039.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:53505783`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B65,D6
`Chr7:53505799`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,B140
`Chr7:53507452`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B138,B22,B30,C72
`Chr7:53508125`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B13,B36,B62
`Chr7:53508453`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A13
`Chr7:53508471`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B64,C11,C69
`Chr7:53508483`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B128

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057776039.1

315 aa

158

315

adh_short

Epimerase

adh_short_C2

PF00106 adh_short 32-179 aa PF08659 KR 33-132 aa PF01370 Epimerase 33-211 aa PF13561 adh_short_C2 36-243 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057776039.1`	Pfam	`PF00106`	adh_short	Domain	32	179	2.3e-31	109.5	short chain dehydrogenase
`XP_057776039.1`	Pfam	`PF08659`	KR	Family	33	132	1.6e-07	32.2	KR domain
`XP_057776039.1`	Pfam	`PF01370`	Epimerase	Family	33	211	9.6e-06	25.9	NAD dependent epimerase/dehydratase family
`XP_057776039.1`	Pfam	`PF13561`	adh_short_C2	Domain	36	243	3.9e-15	56.8	Enoyl-(Acyl carrier protein) reductase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057920056.1
TCAAGATATGTAAATGCTACATTGCTATTCTAGATTCTCAATGCAATAAAGACTTAAAGAGAGAAATAAATTCAAATGTGAATCACATCAATAAAGTACTTACGTGTACCAATAGCTGTCGCCACCACCATCGAAATAATAATAATCCAAATCTACAAGAAAATACCACAGATTCCCAGAAAGCAGCATAACAGTAGTTGCATTGAGTTTCTAGCTCTTTATCTAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAGATGTGGATTTTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994917
ATGTGGATTTTCGGAAGGAAAGGGCCGTCAGGATTTTCAGCCTGCTCTACTGCAGAGGAAGTTACTCAAGGAATTGATGGCTCTGCTCTCTCCGCCATCGTCACTGGAGCATCAAGTGGCATTGGAGCAGAAACTGCTAGAGTCCTGGCATTACGTGGTGTTAATGTAGTTATGGCAGTGCGTAATGTGGAGAGCTGCAAAAAAGTCAAAGAAGCAATAATCAAAGAGTCCCCTAAAGCTAAAATTGATGTTATGGAACT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057776039.1
MWIFGRKGPSGFSACSTAEEVTQGIDGSALSAIVTGASSGIGAETARVLALRGVNVVMAVRNVESCKKVKEAIIKESPKAKIDVMELDLASLASVRKFASEYNSSELPLNLLINNAGVMATPFMLSQDNIEMQFATNHLGHFLLTNLLLENMKKTARESGKEGRIVNVSSEAHRYPYREGIRFDKINDSSSYNSILAYGQSKLANVLHANELTRLFQEEGVKITANSLHPGAIATNLLRHHGLIEGLVNWVGKYFIKDIP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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