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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G004211`

染色体: Chr07 坐标: 54313153-54315808 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G004211`
名称	SmilChr07G004211
描述	uncharacterized SmilChr07G004211
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	54313153 - 54315808 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994925`
GeneID	`130994925`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994925`
原始查询	`LOC130994925`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	small nuclear ribonucleoprotein associated protein B [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827792]; symbol=smB; hit=AT4G20440; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	small nuclear ribonucleoprotein associated protein B [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827792]; symbol=smB; hit=AT4G20440; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT4G20440` (smB) small nuclear ribonucleoprotein associated protein B [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827792] identity=86.7; qcov=0.564; evalue=1.38e-83; confidence=medium
Rice	`-` -
GO	GO:0000398 (mRNA splicing, via spliceosome); GO:0003723 (RNA binding); GO:0005682 (U5 snRNP); GO:0005685 (U1 snRNP); GO:0005686 (U2 snRNP); GO:0005687 (U4 snRNP); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0046540 (U4/U6 x U5 tri-snRNP complex); GO:0071004 (U2-type prespliceosome); GO:0071013 (catalytic step 2 spliceosome)
KEGG	smil03040 (Spliceosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01423 (LSM)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994925

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057776063.1`
2	Nucleoplasm	核质	1.00000	`XP_057776063.1`
3	Chromatin	染色质	0.80000	`XP_057776063.1`
4	Nuclear body	核内小体	0.40000	`XP_057776063.1`
5	Nuclear speckle	核斑点	0.40000	`XP_057776063.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:54313329`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr7:54313401`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B113,C53,C83,D2
`Chr7:54313467`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B56,B96
`Chr7:54313535`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A10,B28,B8
`Chr7:54313554`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr7:54313571`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B127,B44
`Chr7:54313575`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr7:54313602`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B118,B93,C11,C19,C69
`Chr7:54313623`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,A7
`Chr7:54313680`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr7:54313750`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C71
`Chr7:54314070`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B118,C11,C19,C69

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057776063.1

280 aa

140

280

LSM

PF01423 LSM 9-80 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057776063.1`	Pfam	`PF01423`	LSM	Domain	9	80	5.1e-17	62.0	LSM domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057920080.1
CCCCCCATTTTCACTCTCTAGTTCTAATTTTCCCCCCTTTCCTTTCACACACACACACAAAACCCTAGAGTAGGCTGCGCTTCTCCTCCGCCGGCGAAAATGTCGATGTCGAAGAGTTCGAAGATGCTGCAGTACATCAACTACCGCATGCGGGTGACGATCCAGGACGGCCGCCAGCTAATCGGGAAATTCATGGCCTTCGATCGCCACATGAACCTCGTCCTCGGCGACTGCGAGGAGTTCCGCAAGCTGCCGCCGAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994925
ATGTCGATGTCGAAGAGTTCGAAGATGCTGCAGTACATCAACTACCGCATGCGGGTGACGATCCAGGACGGCCGCCAGCTAATCGGGAAATTCATGGCCTTCGATCGCCACATGAACCTCGTCCTCGGCGACTGCGAGGAGTTCCGCAAGCTGCCGCCGACGAAAGGCTCCAAGGAGGAGCGCGAAGACCGCCGCACCCTCGGCCTCGTCCTCCTCCGCGGCGAGGAGGTCATCTCGCTCACAGTCGAGGGGCCCCCGCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057776063.1
MSMSKSSKMLQYINYRMRVTIQDGRQLIGKFMAFDRHMNLVLGDCEEFRKLPPTKGSKEEREDRRTLGLVLLRGEEVISLTVEGPPPPDDSRLKTASATAVPGPGMGRAAGRGVVTGPLSQAQPGLAGPVRGVGGPAPGMMQPQISRPPQISVPPMSYPQQPPVVRPPSVAPPPGGFPPRPGMPMPPPPQFRPGGPPPAGFGPPPQYGQRPQMMPPPQMMRGPPPPGGPPRPGMPGGPPPGQQPPRPGMAPPPPPGGQVQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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