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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G004345`

染色体: Chr07 坐标: 55983515-55986514 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G004345`
名称	SmilChr07G004345
描述	transcription factor MYBS3-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	55983515 - 55986514 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994938`
GeneID	`130994938`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994938`
原始查询	`LOC130994938`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcription factor MYBS3-like
产物	transcription factor MYBS3-like
Arabidopsis	`AT5G56840` (AT5G56840) myb-like transcription factor family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835786] identity=48; qcov=0.67; evalue=1.8e-35; confidence=medium
Rice	`Os01g0603300` (P0681B11.9-1) - identity=40.6; qcov=0.857; evalue=6.9e-35; confidence=medium
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0008270 (zinc ion binding); GO:0009723 (response to ethylene); GO:0009733 (response to auxin); GO:0009739 (response to gibberellin)
KEGG	-
Pfam	PF00249 (Myb_DNA-binding)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994938

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057776105.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057776105.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057776105.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057776105.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057776105.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:55983652`	`G`	`GC`	1bp_insertion	frameshift_variant	13	A20,A6,B105,B129,B31,B4,B54,C1,C10,C17,C35,C60,C9
`Chr7:55983653`	`G`	`GGA`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	C13,C21
`Chr7:55983653`	`G`	`GGA`	2bp_insertion	CDS_variant	2	C13,C21
`Chr7:55983654`	`G`	`GGT`	2bp_insertion	frameshift_variant	13	A20,A6,B105,B129,B31,B4,B54,C1,C10,C17,C35,C60,C9
`Chr7:55983798`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B2,B99,C23,C27,C71
`Chr7:55986344`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A13
`Chr7:55986346`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B134,B26
`Chr7:55986459`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C1

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057776105.1

230 aa

115

230

Myb_DNA-binding

PF00249 Myb_DNA-binding 90-135 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057776105.1`	Pfam	`PF00249`	Myb_DNA-binding	Domain	90	135	1.2e-10	42.0	Myb-like DNA-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057920122.1
CACAACCCTATCTCTCACACACACAGAGAGTTGGAGAGTTGAAAATGGGAGTGAGGAAATGCTCCAAGTGCGGGAAAACGGGTCACAATTCAAGAACTTGCAGAAATGATTCATCAAGAAGAGAGAATTGTGGTCAAATTATGAGGCTTTTTGGTGTGGAAGTAGCAAGAGTGGCATCTCCTAGTGATGGATTTGGGCTCATAAAGACTTTGAATTTTAATCAAATGGAATTAGTATCATCTTCCGACCAAGATTCTGAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994938
ATGGGAGTGAGGAAATGCTCCAAGTGCGGGAAAACGGGTCACAATTCAAGAACTTGCAGAAATGATTCATCAAGAAGAGAGAATTGTGGTCAAATTATGAGGCTTTTTGGTGTGGAAGTAGCAAGAGTGGCATCTCCTAGTGATGGATTTGGGCTCATAAAGACTTTGAATTTTAATCAAATGGAATTAGTATCATCTTCCGACCAAGATTCTGATAAACTTAAGCATGTTGGAACACTTCATCAACCCCAGAGGAAAAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057776105.1
MGVRKCSKCGKTGHNSRTCRNDSSRRENCGQIMRLFGVEVARVASPSDGFGLIKTLNFNQMELVSSSDQDSDKLKHVGTLHQPQRKKGIPWSEEEHRLFLIGLEKLGKGNWRGISRNFVTTRTSTQVASHAQKYFLRQNNANKNKFTPTVLSMVRRNEAQCCIYSKKKPNNSPLRLPKSPYFCRLYNDSAAQNSPCSLELSLAAPPLPAAAVWERRPVVLWKKQYVVKKI

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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