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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G004135`

染色体: Chr07 坐标: 53128345-53129332 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G004135`
名称	SmilChr07G004135
描述	protein NRT1/ PTR FAMILY 2.13-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	53128345 - 53129332 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994940`
GeneID	`130994940`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994940`
原始查询	`LOC130994940`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein NRT1/ PTR FAMILY 2.13-like
产物	protein NRT1/ PTR FAMILY 2.13-like
Arabidopsis	`AT1G69870` (NRT1.7) nitrate transporter 1.7 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843323] identity=52; qcov=1.02; evalue=5.16e-83; confidence=high
Rice	`Os01g0913300` (OsNRT1.7) - identity=52.5; qcov=0.991; evalue=7.58e-76; confidence=high
GO	GO:0005886 (plasma membrane); GO:0022857 (transmembrane transporter activity); GO:0055085 (transmembrane transport)
KEGG	-
Pfam	PF00854 (PTR2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994940

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057776108.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057776108.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057776108.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057776108.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057776108.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:53128505`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B21,B33
`Chr7:53128584`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C47
`Chr7:53128588`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr7:53128591`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	31	A19,A24,A4,A6,B104,B105,B110,B137,B26,B42,B43,B54,B69,B82,B90,B92,B94,C14,C21,C25,C29,C30,C34,C35,C54,C56,C57,C58,C65,C80,D9
`Chr7:53128627`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B12,B55
`Chr7:53128635`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B135,C20,C61,C80,D6
`Chr7:53128659`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B124,B71,C16
`Chr7:53128681`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	18	A21,A8,B107,B124,B129,B132,B18,B3,B42,B43,B48,B8,B97,C15,C27,C53,C8,D1
`Chr7:53128692`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B47
`Chr7:53128694`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B28,B64,C67
`Chr7:53128695`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B12,C48
`Chr7:53128705`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B109,B133,B35,B69,C30

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057776108.1

225 aa

112

225

PTR2

PF00854 PTR2 1-159 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057776108.1`	Pfam	`PF00854`	PTR2	Family	1	159	8.2e-30	104.7	POT family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057920125.1
TGGATGGATCCAACTCCAACCCGTGGAGGCTATGCAGCGTCCAAAAAGTGGAAGAAACCAAATGCCTATTCAAAATCATCCCGATTTGGGCTTCCGGGATTATCTGTTTTACCGCCATTGTACAACAGAGCACATTCATCTTGTCTCAAGCCTTGACAATGGACCGCCACCTCGGTCCCAACTTTCAGATCCCGGGCGGGTCGCTCGGGGTCATCTCGATGATCACGGTGGCGCTATGGATCCCCGTGTACGACCGGGTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994940
ATGGACCGCCACCTCGGTCCCAACTTTCAGATCCCGGGCGGGTCGCTCGGGGTCATCTCGATGATCACGGTGGCGCTATGGATCCCCGTGTACGACCGGGTGGTGGTGCCGTCCGTGAAGAAGGTCACCAAGGTGGAAGGTGGCATCACCTTGCTCCAGAGGATGGGGATCGGGCTCGTGTTCTCCATCCTCTTGATAGTAGTGTCCGGCCTGGTCGAGCGGATGAGAAGGGCCTCTGCCCTAGCTCACGCTGGACCAGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057776108.1
MDRHLGPNFQIPGGSLGVISMITVALWIPVYDRVVVPSVKKVTKVEGGITLLQRMGIGLVFSILLIVVSGLVERMRRASALAHAGPGGTTTLTVFWLAPQLMLMGFAEAFNIIGQIEFYNKEFPENMTSLANSLFSCTMAGASYISAALVNIVHHTTATRAHPDWLTKDINQGRLENLYFLIAGLGVLNFGYFIWAARGYQYKTKIRIDDEHVELVDKENQKSLV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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