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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G004239`

染色体: Chr07 坐标: 54802035-54805713 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G004239`
名称	SmilChr07G004239
描述	molybdenum cofactor sulfurase-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	54802035 - 54805713 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994947`
GeneID	`130994947`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994947`
原始查询	`LOC130994947`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	molybdenum cofactor sulfurase-like
产物	molybdenum cofactor sulfurase-like
Arabidopsis	`AT1G16540` (ABA3) molybdenum cofactor sulfurase (LOS5) (ABA3) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838224] identity=69.5; qcov=0.785; evalue=3.57e-73; confidence=high
Rice	`Os06g0670000` (MCSU3) - identity=55.3; qcov=0.943; evalue=4.84e-65; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00266 (Aminotran_5)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994947

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057776130.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057776130.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057776130.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057776130.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057776130.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:54802254`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	12	B114,B127,B138,B25,B32,B34,B68,B84,B87,B88,C36,C84
`Chr7:54802300`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,B12
`Chr7:54802353`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A16,B118,B41,B61
`Chr7:54802364`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr7:54802391`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B26,C42,C43,C5
`Chr7:54802441`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C61
`Chr7:54802522`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A23,B37,B64
`Chr7:54802532`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B60
`Chr7:54802666`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C41
`Chr7:54802666`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C41
`Chr7:54802689`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B107,B131,B31
`Chr7:54802850`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057776130.1

209 aa

104

209

Aminotran_5

PF00266 Aminotran_5 85-197 aa

XP_057776131.1

209 aa

104

209

Aminotran_5

PF00266 Aminotran_5 85-197 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057776130.1`	Pfam	`PF00266`	Aminotran_5	Domain	85	197	1.1e-13	51.6	Aminotransferase class-V
`XP_057776131.1`	Pfam	`PF00266`	Aminotran_5	Domain	85	197	1.1e-13	51.6	Aminotransferase class-V

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057920147.1
TTTCTCTCTTCACCATCGTCGCGCCCTGCCACCGCCGTCGCGACTCGCCGCCACGACCAGCGTCGCTGCCACGCCGGCCGTCTGCTCGGCCGGATTCCACCATCATTTCCCCTAAATTGGTTTCCGACCTCAGGGCTAGGGTTCCGCCGAGCAGGATTTTGAAGAAGGCGTCGGACGACGCGGTCGTCTCCTGCCTGCGGATTGCCACTCCCGTCGACCAGCTGCCCAGAATCGACGCCTAGGGTTTTCAGCCTCCCTCT...

XM_057920148.1
ATCATGATAGTTCTCGGAACTTATGTGCTTTTGCTTTTGATTAAGTCTTTTTTTCATACCTGCTTTTGCTTGTGGGTCGATCATGAGGGGTTAATCATACTTCCCATTTATTGACCTTTTGATTCAAATACTAGGAAGATGCAACCTTTGGTGCATACAGATCTTTGAAATAAACTGCTTGTTCTATATCTGTTGTATGCATATTTTTGCAATTTGTGTTGATAGTCTTTATGGCATCTTTCATGCTGGTTGTGGTGTAA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130994947
ATGATCTTGCTCTACAGATATGGTATGTATAATTTAAGAGTAAAGAGATGTCGAAAGTCAACAACTTGTTGCTGGAGAAAGGGTTGTGGGAATTTTGTATTATGTGATGCAAACTTGCTAGGTGAGACGTACAATTTATTTGCATTTCCATCGGAGTGTAACTTCTCAGGTCTTAGATTCAACCTTGACCTGGTTAATTCCATAAAGGAAGGTTCTTATCAAATGCCCGGAACTTCTCCAACTCAGAGTGGTCACTGGAT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057776130.1
MILLYRYGMYNLRVKRCRKSTTCCWRKGCGNFVLCDANLLGETYNLFAFPSECNFSGLRFNLDLVNSIKEGSYQMPGTSPTQSGHWMVLIDAAKGSSTCPPDLSKYKADFVVVSFYKLFGYPTGIGALIARNESMKLLKKTYFSGGTVAASVADIDFYQRRDGVEEYFEDGTVSFLSIASLHHGFKVLNTLTMPAIAWCHGTSSYHQHQ

XP_057776131.1
MILLYRYGMYNLRVKRCRKSTTCCWRKGCGNFVLCDANLLGETYNLFAFPSECNFSGLRFNLDLVNSIKEGSYQMPGTSPTQSGHWMVLIDAAKGSSTCPPDLSKYKADFVVVSFYKLFGYPTGIGALIARNESMKLLKKTYFSGGTVAASVADIDFYQRRDGVEEYFEDGTVSFLSIASLHHGFKVLNTLTMPAIAWCHGTSSYHQHQ

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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