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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G004230`

染色体: Chr07 坐标: 54581731-54582974 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G004230`
名称	SmilChr07G004230
描述	probable thionin-2.4
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	54581731 - 54582974 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994966`
GeneID	`130994966`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994966`
原始查询	`LOC130994966`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable thionin-2.4
产物	probable thionin-2.4
Arabidopsis	`AT1G66100` (AT1G66100) Plant thionin [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842924] identity=55; qcov=1.05; evalue=6.86e-41; confidence=medium
Rice	`Os06g0514100` (Osthi7) - identity=49.6; qcov=1.02; evalue=3.36e-28; confidence=medium
GO	GO:0006952 (defense response)
KEGG	-
Pfam	PF00321 (Thionin)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994966

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057776166.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057776166.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057776166.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057776166.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057776166.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:54581859`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B62
`Chr7:54581899`	`C`	`CGA`	2bp_insertion	frameshift_variant	34	A10,A11,A15,A16,B104,B113,B127,B16,B18,B23,B35,B38,B39,B44,B45,B5,B62,B68,B7,B76,B77,B82,C15,C17,C31,C33,C48,C49,C53,C60,C63,C70,C72,C80
`Chr7:54581900`	`AGC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	34	A10,A11,A15,A16,B104,B113,B127,B16,B18,B23,B35,B38,B39,B44,B45,B5,B62,B68,B7,B76,B77,B82,C15,C17,C31,C33,C48,C49,C53,C60,C63,C70,C72,C80
`Chr7:54581918`	`A`	`ATC`	2bp_insertion	frameshift_variant	3	A16,B16,C48
`Chr7:54581918`	`A`	`ATC`	2bp_insertion	CDS_variant	3	A16,B16,C48
`Chr7:54581919`	`A`	`ACC`	2bp_insertion	frameshift_variant	13	A10,A15,B104,B127,B18,B38,B39,B5,B68,B77,C31,C53,C70
`Chr7:54581921`	`CGT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	16	A10,A15,A16,B104,B127,B16,B18,B38,B39,B5,B68,B77,C31,C48,C53,C70
`Chr7:54581926`	`CTG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	3	A10,B127,C70
`Chr7:54581926`	`CTG`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	3	A10,B127,C70
`Chr7:54581930`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A16,B16,B7,C48
`Chr7:54581937`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B7
`Chr7:54581938`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057776166.1

125 aa

125

Thionin

PF00321 Thionin 30-67 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057776166.1`	Pfam	`PF00321`	Thionin	Domain	30	67	1e-09	39.5	Plant thionin

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057920183.1
GCAGAACACCTAGTATTTAAGCTGGCTAATTTCATCAATATATACAAACTTGTATTACTTCTGTATATTTTGTAATCAAAAGAGAGAAGATGATATCCATGGAAGCTAAAAGTCTTATTATGAGTGCTCTTTTGCTGAGCCTTGTTTTGGGACAAATTCAAGTTGAGGCAGCAACGAGTTGTTGCCCAAACGTCACTGCCAGAAATGCCTATAATGTCTGTCCTTGTGCAAACTACAGTGGATGCAAACTTATTAATGGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994966
ATGATATCCATGGAAGCTAAAAGTCTTATTATGAGTGCTCTTTTGCTGAGCCTTGTTTTGGGACAAATTCAAGTTGAGGCAGCAACGAGTTGTTGCCCAAACGTCACTGCCAGAAATGCCTATAATGTCTGTCCTTGTGCAAACTACAGTGGATGCAAACTTATTAATGGGGGTACATGTCCCACTGGTTGGACTAACGATATTCTCGAAAACACTGTCGATGAATTCTGCAAGTTGGGGTGTGCATCCTCCGTTTGCGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057776166.1
MISMEAKSLIMSALLLSLVLGQIQVEAATSCCPNVTARNAYNVCRXCANYSGCKLINGGTCPTGWTNDILENTVDEFCKLGCASSVCAAITTLQNSDASEVVNGAAEKCSQACSAFCTKASISAA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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