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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003667`

染色体: Chr01 坐标: 55090903-55094023 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003667`
名称	SmilChr01G003667
描述	cyclin-B2-3-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	55090903 - 55094023 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994971`
GeneID	`130994971`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994971`
原始查询	`LOC130994971`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cyclin-B2-3-like
产物	cyclin-B2-3-like
Arabidopsis	`AT1G76310` (CYCB2;4) CYCLIN B2;4 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843964] identity=59.8; qcov=1.07; evalue=8.09e-175; confidence=high
Rice	`Os06g0726800` (cycB2) - identity=53.8; qcov=1.05; evalue=5.6e-155; confidence=high
GO	GO:0000079 (regulation of cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activity); GO:0000307 (cyclin-dependent protein kinase holoenzyme complex); GO:0005634 (nucleus); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0005813 (centrosome); GO:0016538 (cyclin-dependent protein serine/threonine kinase regulator activity); GO:0044772 (mitotic cell cycle phase transition)
KEGG	-
Pfam	PF00134 (Cyclin_N); PF02984 (Cyclin_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994971

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057776174.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057776174.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057776174.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057776174.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057776174.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:55091512`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75
`Chr1:55091522`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B102,B131,B18
`Chr1:55091642`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B27
`Chr1:55091923`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B18,B31,B32,B34,C37
`Chr1:55091941`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C11,C69
`Chr1:55092789`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A2,B133,B137,B9,C47
`Chr1:55092905`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C5,C6
`Chr1:55093304`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C11,C69
`Chr1:55093500`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B103
`Chr1:55093500`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B103
`Chr1:55093505`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,B129

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057776174.1

401 aa

200

401

Cyclin_N

Cyclin_C

PF00134 Cyclin_N 147-273 aa PF02984 Cyclin_C 275-391 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057776174.1`	Pfam	`PF00134`	Cyclin_N	Domain	147	273	6.2e-48	162.4	Cyclin, N-terminal domain
`XP_057776174.1`	Pfam	`PF02984`	Cyclin_C	Domain	275	391	3.5e-38	131.0	Cyclin, C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057920191.1
AACTTTCATCGTACAACCAATTTCGTTCACTAGCCGTTGTTTTCAAATATATTCTAGAGAGAGAGAGGGAAGAGAGGAGAGAGAAAACAGACACGCACCCGCTGTTTACGTTCTCTTCAAAACCCTCTTCTGGAATTCAATCGAAACAACATTCAAGAAAGCAAAGATTCTCTCTCTGTGTCAGAGAGAGGGAGATTTAAGTGTTTGAAGAAGACACAAGATGGGCGGACCAAGTGAGAATTTTCATGGCGTGATCAGAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994971
ATGGGCGGACCAAGTGAGAATTTTCATGGCGTGATCAGACATTCAAACATTCATGGGCAAAATAGGAAGGCGTTGAGCACAATCGACAGCAATGTTATAGGAATTCACAGAAGGGGCGTTTTGACAGAGAAAAATGCTGCCTTTCAGAAGAATCCCATGGCTCCACTTCATCGTCCAGTTACTAGGAAGTTTGCTGCACAGTTGGCTGTCAAAGAGAAGCAGGAACAAAGAGCCGCGTCTCAATCATCAGACTGCGTTAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057776174.1
MGGPSENFHGVIRHSNIHGQNRKALSTIDSNVIGIHRRGVLTEKNAAFQKNPMAPLHRPVTRKFAAQLAVKEKQEQRAASQSSDCVIMDAEDHDVPMFVQHTEAMLVEIDRMDAEVEMEDLDSDEPIVDIDACDEKNPLAVTEYIDDIYAHYKKTESSSCVPSNYMAGQLDINDRMRGILIDWLIEVHYKFELMDETLYLTVNLIDRFLAVQRVERKRLQLVGVTAMLLACKYEEVSVPVVEDLVLISDKAYSRKEVLDM...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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