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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G004172`

染色体: Chr07 坐标: 53657036-53657792 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G004172`
名称	SmilChr07G004172
描述	puromycin-sensitive aminopeptidase-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	53657036 - 53657792 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994972`
GeneID	`130994972`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994972`
原始查询	`LOC130994972`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	puromycin-sensitive aminopeptidase-like
产物	puromycin-sensitive aminopeptidase-like
Arabidopsis	`AT1G63770` (AT1G63770) Peptidase M1 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842681] identity=78.4; qcov=0.787; evalue=1.62e-33; confidence=medium
Rice	`-` -
GO	GO:0008270 (zinc ion binding); GO:0009507 (chloroplast)
KEGG	-
Pfam	PF17432 (DUF3458_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994972

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057776172.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057776172.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057776172.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057776172.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057776172.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:53657146`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A10,B28,B8
`Chr7:53657328`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	A14,B31,B4
`Chr7:53657328`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A14,B31,B4
`Chr7:53657351`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	43	A10,A15,A20,A9,B10,B102,B107,B118,B126,B128,B134,B18,B20,B21,B23,B29,B30,B32,B38,B39,B44,B48,B55,B58,B63,B65,B7,B72,B86,C13,C18,C26,C28,C49,C50,C54,C60,C65,C70,C81,D4,D5,D7
`Chr7:53657497`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B104
`Chr7:53657497`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr7:53657516`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B134
`Chr7:53657518`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	12	B111,B112,B61,B7,B76,B88,C12,C17,C47,C79,C84,D3
`Chr7:53657547`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr7:53657671`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B103
`Chr7:53657682`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	12	A19,B120,B74,B79,B90,B91,B92,B97,C12,C14,C82,D9
`Chr7:53657685`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057776172.1

94 aa

DUF3458_C

PF17432 DUF3458_C 24-93 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057776172.1`	Pfam	`PF17432`	DUF3458_C	Repeat	24	93	3.9e-25	89.6	Domain of unknown function (DUF3458_C) ARM repeats

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057920189.1
CATACGCATCCGAGTTCAATTTTTTTCGTTTTACAGGTTATAAATAAGTGGTTTACCCTCCAAGCCATGTCGAATATACCCGGGAACATTGCAAATGTTCGTAAACTGTTGGACCACCCTGCTTTTGACATCCGTAATGCCAATAAGGTGTACTCGCTCATCGGAGGATTCTGGCTACAAATTTTTGGGCGAAATGGTGGTACAGCTCGACAACATATATCCTCAGGTGGCTTCACGGATGGTATCAGCCTTCTCTACAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994972
ATGTTCGTAAACTGTTGGACCACCCTGCTTTTGACATCCGTAATGCCAATAAGGTGTACTCGCTCATCGGAGGATTCTGGCTACAAATTTTTGGGCGAAATGGTGGTACAGCTCGACAACATATATCCTCAGGTGGCTTCACGGATGGTATCAGCCTTCTCTACATGGAAACGCTATGATGAAACCAGGCGAAATCTTGCTAAGGCTCTACTGGAAATGATACTAGCTGCAAACGGGCTGTCCGAAAATGTGTTTGAGAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057776172.1
MFVNCWTTLLLTSVMPIRCTRSSEDSGYKFLGEMVVQLDNIYPQVASRMVSAFSTWKRYDETRRNLAKALLEMILAANGLSENVFEIASKSLAA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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