当前解析结果
SmilChr07G004149| 统一新 Gene ID | SmilChr07G004149 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G004149 |
| 描述 | MICOS complex subunit MIC10-like |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 53318528 - 53318789 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130994974 |
|---|---|
| GeneID | 130994974 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130994974 |
| 原始查询 | LOC130994974 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | MICOS complex subunit MIC10-like |
| 产物 | MICOS complex subunit MIC10-like |
| Arabidopsis | AT1G22520 (AT1G22520)MICOS complex subunit Mic10-like protein (DUF543) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838858] identity=63.6; qcov=0.985; evalue=6.17e-27; confidence=medium |
| Rice | Os03g0840900- identity=63.3; qcov=0.896; evalue=7.48e-24; confidence=medium |
| GO | GO:0005739 (mitochondrion); GO:0005743 (mitochondrial inner membrane); GO:0061617 (MICOS complex) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF04418 (DUF543) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130994974 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Mitochondrion | 线粒体 | 1.00000 | XP_057776176.1 |
| 2 | Mitochondrion membrane | 线粒体膜 | 1.00000 | XP_057776176.1 |
| 3 | Mitochondrion inner membrane | 线粒体内膜 | 1.00000 | XP_057776176.1 |
| 4 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057776176.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057776176.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:53318575 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B133 |
Chr7:53318653 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B41 |
Chr7:53318688 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B19 |
Chr7:53318768 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B87,C23,D7 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057776176.1PF04418
DUF543 5-66 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057776176.1 |
Pfam | PF04418 |
DUF543 | Domain | 5 | 66 | 4.1e-19 | 69.0 | Domain of unknown function (DUF543) |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。