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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G004439`

染色体: Chr07 坐标: 57046617-57049011 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G004439`
名称	SmilChr07G004439
描述	ran-binding protein 1 homolog c-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	57046617 - 57049011 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995054`
GeneID	`130995054`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995054`
原始查询	`LOC130995054`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ran-binding protein 1 homolog c-like
产物	ran-binding protein 1 homolog c-like
Arabidopsis	`AT5G58590` (RANBP1) RAN binding protein 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835973] identity=67; qcov=0.845; evalue=5.72e-89; confidence=high
Rice	`Os05g0350600` - identity=68.5; qcov=0.764; evalue=3.92e-84; confidence=high
GO	GO:0005096 (GTPase activator activity); GO:0005643 (nuclear pore); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0006913 (nucleocytoplasmic transport)
KEGG	-
Pfam	PF00638 (Ran_BP1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995054

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057776187.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057776187.1`
3	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057776187.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.40000	`XP_057776187.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057776187.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:57046784`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C23,C73
`Chr7:57046848`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B75,C46,C67
`Chr7:57046855`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr7:57046874`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B29,C11,C32,C83
`Chr7:57046888`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B103,B16,B93,C56
`Chr7:57046903`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr7:57046924`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C75
`Chr7:57047704`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B101,B131,B24,B53,D5
`Chr7:57047891`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A18,B49,C40
`Chr7:57048573`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A11,B46,B80,C46,D7
`Chr7:57048587`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A11,B46,B80,C46,D7
`Chr7:57048588`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057776187.1

233 aa

116

233

Ran_BP1

PF00638 Ran_BP1 44-160 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057776187.1`	Pfam	`PF00638`	Ran_BP1	Domain	44	160	9.3e-42	142.9	RanBP1 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057920204.1
CAGCCCATCTAGACCCATACAGCGTCTGCTTTGTTAATACGCTATACAACATGTAAGTATATATATTCACAGATTAGCTAGCTCCAGACCTGCTTCATCGCTCGCTGCTTAAACCCTAACTCTGCTCACAGATCTCAAAATCTATCGAAATTACTACGGTTATGGCTGCACCAGCTGAGCCCACACTTCTAAGGAGAGAGGAGGAAGAAGATGACGATTCGAAGCCGGCCGCCGATGACGAGGATACCGGCGCTCAGGTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130995054
ATGGCTGCACCAGCTGAGCCCACACTTCTAAGGAGAGAGGAGGAAGAAGATGACGATTCGAAGCCGGCCGCCGATGACGAGGATACCGGCGCTCAGGTTGCTCCGATCGTCCAGCTGCAGGAAGTCGCCGTCACCACCGGTGAAGAGAACGAAGATGTTCTTCTTGAATTGAAATCAAAGTTGTACAGATTTGACAGAGACGGTAATCAATGGAAGGAGAGGGGTGTGGGGACTGTGAAGCTGCTAAAGCACAAGGAGAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057776187.1
MAAPAEPTLLRREEEEDDDSKPAADDEDTGAQVAPIVQLQEVAVTTGEENEDVLLELKSKLYRFDRDGNQWKERGVGTVKLLKHKETGKVRLVMRQNKTLKICANHLVLATMSVQEHQGNDKSCVWHAADFSDGELKDETFCIRFASVENCRTFKDKIAEIAEGQANDNGEGKEEGQANDNGEGEEGETAASLIEKLSVGAKDEEEKPESKAAPSSSAEKKGKEEKPEAAAEK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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