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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及有 accession 序列支持的文献基因名查询；未闭环名称仅提供候选导航。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G004449`

染色体: Chr07 坐标: 57108656-57109476 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G004449`
名称	SmilChr07G004449
描述	uncharacterized SmilChr07G004449
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	57108656 - 57109476 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995062`
GeneID	`130995062`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995062`
原始查询	`LOC130995062`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ABC family ABC transporter, putative (DUF3511) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831070]; symbol=AT5G11970; hit=AT5G11970; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	ABC family ABC transporter, putative (DUF3511) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831070]; symbol=AT5G11970; hit=AT5G11970; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT5G11970` (AT5G11970) ABC family ABC transporter, putative (DUF3511) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831070] identity=50.45; qcov=1.0; evalue=3.32e-27; confidence=medium
Rice	`Os03g0302500` - identity=68.75; qcov=0.436; evalue=3.64e-20; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF12023 (DUF3511)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995062

打开注释模块

非零投票定位候选（最多五项）

Rank	定位位置	中文	五折投票比例	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057776194.1`
2	Cell membrane	细胞膜	0.60000	`XP_057776194.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057776194.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:57108911`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65
`Chr7:57108961`	`GCC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	7	A14,B114,B136,B36,B65,C29,D3

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057776194.1

110 aa

110

DUF3511

PF12023 DUF3511 65-109 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057776194.1`	Pfam	`PF12023`	DUF3511	Family	65	109	3.2e-26	91.6	Domain of unknown function (DUF3511)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057920211.1
ATAACACAATACGAAATGTCAATATATGAAATGGGAAGTCGTGTTTGACTGGTCTAAGTTAACCAGATTTCTTCTTTAAAAATACAAAACCAAAAAAACAATTCCAAAAAAAAAAACTCTATTTTCCCATTTTCTCCCGTTTAAAGCATCCAAGAAAGCATAAAAAAAAAGTAGAAAAAATCCATGGCGGATTACAGATCAAACTTGTACAGCGATTCCGACATGCAAATAGAGCCTTATTACCGGCCCCCATCCGCCGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130995062
ATGGCGGATTACAGATCAAACTTGTACAGCGATTCCGACATGCAAATAGAGCCTTATTACCGGCCCCCATCCGCCGGCGACTTCCGATCGTACAGCACGACTTCGTACTACCAGACGGCGGCGCCGCCGCCGCCGCCGCGGAAGCTGAAGAAGGGGAAGAGCATGGGCGCGTCGCTATCGAAGTCGTGGAGCTTTAACGATCCGGAGATTCAGAGGAAGAAGAGGGTCGCGAGCTATAAGGCTTACACAGTTGAAGGCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057776194.1
MADYRSNLYSDSDMQIEPYYRPPSAGDFRSYSTTSYYQTAAPPPPPRKLKKGKSMGASLSKSWSFNDPEIQRKKRVASYKAYTVEGKVKGSFRRSFRWIKDRCNLLIHGF

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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